Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  20  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7537053--7537093
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19
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7538648--7538752
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0
228
9
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1.78
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26
2.3
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7539268--7539297
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1.9
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50
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2.0
21
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63
2.0
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1.9
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0
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7593288--7593425
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17
70
13
73
37
15
11
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7593415--7593479
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18
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20
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7593394--7593479
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2.4
45
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5
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17
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1.24
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15
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2.0
38
100
0
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0
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29
100
0
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24
10
17
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.57
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2.1
21
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17
1.87
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7725922--7725957
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50
28
17
1
52
1.54
7762122--7762177
16
3.6
16
81
11
71
17
17
0
64
1.30
7762116--7762192
32
2.4
32
85
6
104
18
15
0
66
1.26
7762147--7762218
21
3.3
20
84
13
81
25
12
0
62
1.30
7762294--7762348
25
2.2
25
86
0
74
38
7
0
54
1.28
7764205--7764267
28
2.2
28
80
8
65
36
17
0
46
1.49
7764429--7764453
5
5.0
5
100
0
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0
0
60
0.97
7764222--7764534
112
2.8
108
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4
502
35
13
0
50
1.42
7767644--7767811
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51
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5
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29
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14
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1.94
7767685--7767816
58
2.3
58
89
0
201
28
24
14
32
1.94
7770390--7770575
46
4.0
46
88
1
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22
22
13
40
1.89
7772852--7772910
30
1.9
31
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3
84
30
22
1
45
1.62
7777777--7777808
14
2.3
14
94
0
55
68
6
0
25
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
27
68
16
64
58
1
3
36
1.23
7780852--7780910
22
2.7
21
77
12
55
40
1
3
54
1.27
7781927--7781961
19
1.9
17
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11
52
20
2
11
65
1.37
7781927--7781967
18
2.2
19
83
12
50
21
4
9
63
1.44
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2
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2
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0
0
50
1.00
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3.6
9
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0
55
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0
3
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4.0
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22
22
14
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35
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35
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10
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1.90
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75
2.4
75
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7
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31
11
23
33
1.90
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3.5
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10
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32
1.90
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46
4.8
46
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8
233
24
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1.97
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93
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25
29
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27
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11
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0
1
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4.6
46
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2
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39
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21
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16
2.1
16
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1.81
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2.0
62
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0
178
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20
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7
130
46
12
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18
1.83
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45
2.2
46
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8
125
46
13
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19
1.83
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18
2.2
18
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55
22
2
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1.09
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20
2.0
21
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5
0
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3
9.0
3
100
0
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0
0
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11
4.3
11
81
2
51
6
6
27
60
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7831425--7831472
22
2.1
23
88
3
71
6
6
27
60
1.45
7831402--7831465
22
2.9
22
84
11
85
4
3
34
57
1.35
7831401--7831484
34
2.4
35
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13
84
4
3
30
60
1.34
7832201--7832281
29
2.6
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1.53
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2
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0
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0
3
50
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0
8
0
0.43
7840473--7840506
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0
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0.43
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3.0
340
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0
2022
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31
6.5
31
88
0
287
28
19
25
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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