Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  77  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25692882--25692973
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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3
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0
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0
1
32
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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0
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23
2.2
22
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10
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14
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0
0
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26
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1.23
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152
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13
24
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25883795--25883845
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2
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1.28
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23
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22
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1
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40
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0
51
1.00
25894407--25894466
14
4.3
15
79
14
67
20
6
45
28
1.76
25894757--25894889
35
3.8
35
76
7
128
25
25
27
21
2.00
25905295--25905738
222
2.0
222
99
0
870
30
13
13
43
1.82
25907263--25907683
2
211.5
2
99
0
828
50
0
49
0
1.00
25908100--25908159
16
3.6
16
70
12
50
53
3
3
40
1.34
25910601--25910630
13
2.2
14
94
5
53
83
0
0
16
0.65
25912176--25912238
11
5.5
12
74
9
51
65
3
6
25
1.32
25912177--25912241
23
2.9
23
81
2
78
64
3
4
27
1.28
25912493--25912560
31
2.1
32
86
5
93
54
5
1
38
1.34
25912646--25912694
22
2.2
21
80
16
55
63
0
0
36
0.95
25912697--25912736
19
2.0
19
85
9
53
60
5
15
20
1.53
25914344--25914509
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
25914344--25914514
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
25921824--25921989
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25921824--25921994
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
25931763--25931939
40
4.4
40
91
0
282
20
20
29
28
1.98
25931793--25931959
80
2.1
80
87
2
237
22
23
27
26
2.00
25940853--25941161
27
11.7
26
73
11
85
39
21
8
31
1.82
25940949--25941182
54
4.3
53
83
4
189
39
20
7
32
1.81
25940981--25941272
27
10.8
27
79
3
273
39
18
9
31
1.84
25941033--25941244
109
1.9
109
84
1
282
39
18
8
33
1.82
25940981--25941271
136
2.1
136
82
4
338
39
18
9
31
1.83
25941091--25941517
81
5.3
80
81
5
350
35
19
16
28
1.94
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27
12.3
27
87
0
446
33
20
20
25
1.97
25941983--25942047
22
3.0
22
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60
20
20
23
36
1.95
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26
4.2
26
86
0
162
31
8
25
35
1.85
25946318--25946467
41
3.7
41
85
1
221
28
28
23
20
1.99
25954524--25954632
40
2.7
41
73
2
130
29
27
22
21
1.99
25957309--25957449
27
5.2
27
82
11
182
18
24
23
33
1.97
25957306--25957449
54
2.7
54
94
2
245
18
25
23
33
1.97
25957309--25957467
27
5.9
26
81
2
104
20
24
22
33
1.97
25959505--25959729
46
4.8
46
75
9
206
28
28
20
22
1.99
25959559--25959681
47
2.6
47
96
0
219
28
30
19
21
1.97
25965486--25965593
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
25966763--25966792
8
3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70
25967182--25967322
27
5.2
27
84
11
191
17
24
23
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25967179--25967322
54
2.7
54
95
2
254
17
25
23
34
1.96
25972564--25972671
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
25974251--25974391
27
5.2
27
80
11
173
18
24
23
34
1.96
25974248--25974391
54
2.7
54
93
2
236
18
24
23
34
1.96
25978930--25978966
19
1.9
19
88
0
56
59
2
2
35
1.26
25978930--25978989
10
5.8
10
74
14
50
60
1
1
36
1.17
25979045--25979101
25
2.4
24
80
11
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1
1
35
1.17
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2.3
25
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69
35
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26
16
1.94
25988888--25988934
25
1.9
24
86
4
67
38
21
23
17
1.93
25988860--25988967
24
4.5
24
74
4
74
34
20
25
19
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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