Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  84  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27802237--27802265
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2
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0
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0
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0
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2.0
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1.91
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2.0
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2.0
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0
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2.0
21
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19
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0
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0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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0
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0
0
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26
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21
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15
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12
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9.5
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13
0
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0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2
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19
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2
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53
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20
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136
21
27
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27975511--27975543
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100
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0
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56
1
0
41
1.10
27985280--27985335
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
27989853--27989888
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
27989840--27989880
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
27990003--27990137
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
27990377--27990415
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
27991731--27991783
5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
27991730--27991785
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
27993139--27993169
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
27994149--27994191
19
2.2
20
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4
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48
6
6
37
1.57
27994211--27994264
5
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5
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0
108
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0
0
59
0.98
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11
2.3
11
100
0
50
68
0
32
0
0.90
27995194--27995307
37
2.9
40
73
15
119
27
18
22
31
1.97
27997636--27997729
32
2.9
32
83
10
95
50
8
0
41
1.33
27997656--27997729
33
2.3
32
86
11
98
51
8
0
40
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28003998--28004028
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
28004015--28004083
21
3.4
20
71
16
70
55
7
1
36
1.37
28006819--28006869
25
2.0
25
96
0
93
35
31
17
15
1.92
28008023--28008055
15
2.2
15
100
0
66
21
0
6
72
1.05
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33
2.3
32
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10
93
50
7
1
40
1.40
28008192--28008284
33
2.8
31
77
20
84
48
6
1
44
1.35
28010227--28010266
19
2.1
19
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9
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40
5
2
52
1.37
28013420--28013461
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2.0
21
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35
4
9
50
1.56
28019053--28019091
17
2.4
17
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4
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10
7
0
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0.86
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2.3
22
82
3
55
44
4
2
48
1.33
28023836--28023861
7
3.7
7
100
0
52
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11
0
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1.40
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23
2.1
23
100
0
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25
20
12
41
1.87
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13
5.8
13
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6
102
35
17
6
40
1.75
28031459--28031507
19
2.6
18
78
12
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59
0
2
38
1.09
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5
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11
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0
1
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1.10
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8
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9
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43
0
1
54
1.10
28039847--28039902
12
4.5
12
81
16
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42
0
1
55
1.10
28041219--28041257
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
28041494--28041595
38
2.6
38
75
7
98
23
18
28
29
1.98
28041496--28041630
39
3.4
39
76
6
121
23
19
28
28
1.98
28041753--28041793
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
28049932--28049976
20
2.3
20
88
3
65
26
17
4
51
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28056617--28056919
167
1.8
168
89
0
482
35
17
12
33
1.88
28059032--28059120
43
2.1
42
93
2
151
38
7
24
29
1.84
28062117--28062175
18
3.3
18
78
4
57
28
16
20
33
1.95
28062188--28062235
18
2.6
19
83
9
64
39
4
14
41
1.65
28067659--28067824
43
3.9
43
75
5
140
27
15
25
32
1.95
28070709--28070748
16
2.5
16
100
0
80
35
20
17
27
1.95
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2.1
68
94
0
248
30
21
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1.98
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2.0
36
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0
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22
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1.98
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2.1
17
88
0
52
42
0
14
42
1.45
28079508--28079552
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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