Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  15  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5347099--5347202
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3
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1.40
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20
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5351507--5351679
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1.9
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93
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20
30
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2.0
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0
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1.10
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28
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2.2
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0
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64
2
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25
2.7
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1
4
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5359278--5359480
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3.3
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18
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75
0
2
21
0.92
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3.2
13
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66
75
0
2
21
0.92
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2.2
17
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0
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15
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2
62
37
2
12
47
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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1.53
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46
2.0
45
88
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135
33
13
24
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1.93
5366469--5366574
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2.4
45
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15
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46
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0
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1.00
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0
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2
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22
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10
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1
251
31
15
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29
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2.4
75
84
7
212
32
11
23
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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11
23
33
1.90
5476587--5476758
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2.4
74
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11
216
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11
23
33
1.90
5476592--5476756
35
4.6
35
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9
174
31
11
23
33
1.90
5480606--5480646
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2.1
20
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56
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0
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212
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11
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1.90
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174
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11
23
33
1.90
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2.4
75
84
7
212
32
11
23
33
1.90
5491949--5492114
35
4.6
35
84
8
174
31
11
23
33
1.90
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0
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0
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0
51
50
3
0
46
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5621218--5621261
21
2.1
21
100
0
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13
4
31
1.62
5631144--5631176
2
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2
93
0
57
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3
0
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2.2
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21
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21
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1.56
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2.3
75
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0
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29
4
48
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1.66
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21
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0
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0
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0
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1
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0
50
0
60
20
20
1.37
5663739--5663795
30
1.9
30
82
3
71
36
1
5
56
1.32
5666485--5666532
22
2.0
24
84
11
64
43
4
0
52
1.20
5666495--5666539
23
2.0
23
82
8
56
44
4
2
48
1.35
5671397--5671428
15
2.0
17
88
11
50
65
0
0
34
0.93
5672443--5672473
12
2.7
11
90
9
53
29
0
0
70
0.87
5672454--5672513
30
2.0
30
90
0
93
26
1
13
58
1.45
5672553--5672610
25
2.5
23
76
20
66
32
3
8
55
1.47
5674562--5674624
28
2.2
28
94
0
108
31
4
30
33
1.78
5677493--5677565
21
3.4
21
81
7
76
13
21
24
39
1.90
5680077--5680201
62
2.0
62
98
0
241
22
16
19
42
1.89
5681374--5681398
11
2.3
11
100
0
50
52
16
20
12
1.75
5683916--5683969
26
2.0
29
82
10
69
72
5
18
3
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5684430--5684516
21
4.0
23
79
10
92
16
22
24
36
1.94
5688937--5688999
28
2.2
28
94
0
108
31
4
30
33
1.78
5693481--5693505
12
2.1
12
100
0
50
28
16
8
48
1.74
5693584--5693649
33
2.0
33
96
0
123
46
9
22
21
1.79
5693708--5693732
12
2.1
12
100
0
50
48
8
20
24
1.76
5712093--5712125
16
2.1
16
88
5
50
48
0
3
48
1.17
5720077--5720132
29
1.9
29
85
0
76
41
19
7
32
1.79
5745510--5745553
22
2.0
22
100
0
88
18
18
27
36
1.94
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28
2.1
27
86
3
78
77
10
3
8
1.11
5746862--5746926
33
1.9
32
84
9
85
75
12
3
9
1.15
5747125--5747163
17
2.3
17
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8
53
17
10
0
71
1.12
5747655--5747684
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2.7
11
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0
51
40
0
0
60
0.97
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21
3.2
21
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21
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9
25
26
1.86
5750456--5750531
25
3.2
25
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21
63
42
11
22
23
1.87
5750434--5750781
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7.6
46
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2
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41
13
22
22
1.89
5751079--5751111
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
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1.45
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17
2.0
17
100
0
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5
17
29
1.71
5752401--5752721
46
7.0
47
90
2
438
21
24
14
38
1.92
5755997--5756077
33
2.3
37
74
18
84
43
0
3
53
1.18
5757208--5757240
8
4.2
8
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3
59
66
12
0
21
1.23
5757477--5757516
10
4.0
10
90
0
53
0
7
5
87
0.66
5758771--5758878
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5766151--5766258
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
5769421--5769458
13
2.7
14
88
8
51
39
0
0
60
0.97
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21
2.9
21
83
9
81
40
0
0
59
0.97
5769436--5769497
22
2.9
22
88
4
92
40
0
0
59
0.97
5785624--5785698
27
2.7
27
77
18
84
60
8
1
30
1.34
5785667--5785731
24
2.8
24
75
11
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10
0
26
1.27
5795257--5795296
19
2.2
19
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4
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2
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1.37
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2
100
0
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0
0
50
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32
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13
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1.76
5822211--5822318
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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