Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  118  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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15
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1.56
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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0
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1.97
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11
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31
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30
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32
0
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60
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36078936--36079010
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1.40
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3
8
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1.47
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1.9
19
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0
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32
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2
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1.55
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35
0
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2.8
18
88
5
77
13
35
29
21
1.92
36106867--36106897
14
2.2
14
94
0
53
19
6
12
61
1.53
36106928--36106991
31
2.1
31
88
8
96
28
4
10
56
1.54
36107374--36107415
12
3.3
13
80
12
52
38
7
0
54
1.28
36110611--36110640
11
2.7
11
94
0
51
10
20
16
53
1.71
36110766--36110820
18
3.0
18
78
7
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5
18
0
76
0.97
36110766--36110819
19
2.9
18
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10
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5
16
0
77
0.94
36114993--36115087
40
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39
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16
1.84
36115334--36115374
17
2.5
17
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34
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41
1.77
36116419--36116529
47
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0
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0
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47
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1.94
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4
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4
100
0
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0
24
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0.80
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25
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26
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44
0
0
56
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31
2.1
31
85
5
85
46
0
4
48
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
21
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25
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21
2.5
21
80
0
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30
21
30
1.96
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22
2.0
23
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4
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27
0
22
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1.50
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3
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100
0
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0
0
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5
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2.0
21
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20
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22
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2.1
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2.4
25
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1.9
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2.0
148
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1.93
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2.0
249
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1
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28
1.92
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17
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48
0
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1.47
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42
0
0
57
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3.5
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50
1
2
46
1.23
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1.9
57
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0
1
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15
3.3
15
72
17
50
41
0
1
56
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36200591--36200663
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38
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27
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21
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38
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100
30
26
20
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1.9
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2
0
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0
0
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19
2.0
19
94
0
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34
10
23
31
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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