Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  298  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88870684--88870725
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
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12
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0
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23
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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21
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4
58
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89027215--89027264
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14
54
52
0
0
47
1.00
89028711--89028764
20
2.7
19
69
8
54
20
3
0
75
0.95
89028746--89028780
16
2.2
16
89
0
52
20
0
2
77
0.90
89028787--89028834
21
2.4
19
83
13
60
22
2
2
72
1.05
89028782--89028835
16
3.5
16
78
14
60
24
1
1
72
1.05
89028875--89028969
30
2.9
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14
133
40
0
0
60
0.97
89028877--89028968
36
2.9
30
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19
114
40
0
0
59
0.97
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20
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19
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1
0
50
1.10
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2.0
15
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0
0
31
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1.13
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1.19
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34
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1
1
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1.12
89035030--89035146
36
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33
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146
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0
0
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1.11
89035064--89035108
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2.1
22
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57
2
0
40
1.11
89035093--89035132
11
3.8
11
78
21
50
57
0
0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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57
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0
0
41
1.10
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34
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1
0
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23
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3
0
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1.19
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9
3.8
9
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2
0
17
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15
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10
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17
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0
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2
2
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1.06
89036441--89036482
9
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21
2
2
73
1.06
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44
0
2
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1.13
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2.2
20
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0
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0
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1.05
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20
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0
1
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0
0
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12
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0
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0
0
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1.07
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2.0
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161
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0
1
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1.10
89036608--89036732
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0
1
44
1.09
89036601--89036772
40
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23
120
55
0
1
43
1.10
89036723--89036771
22
2.1
24
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59
0
2
38
1.09
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2.2
15
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0
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0
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3
0.72
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8
4.9
8
87
9
53
82
0
12
5
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89037034--89037081
22
2.2
22
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10
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45
43
6
4
1.48
89039180--89039240
28
2.2
28
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26
3
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60
1.43
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2.0
22
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0
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39
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0
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5
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0
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2
1.06
89043951--89043996
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2.3
20
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4
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1.9
260
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1.50
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24.7
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100
0
148
66
0
0
33
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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