Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  5  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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1540176--1540287
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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0
19
0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1615400--1615432
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11
8
57
1.61
1648462--1648548
33
2.6
33
87
0
120
14
43
11
29
1.81
1648414--1648592
99
1.8
99
81
2
225
16
41
11
30
1.84
1654008--1654180
46
3.8
45
77
13
174
30
29
19
21
1.97
1654016--1654187
93
1.8
93
91
2
283
29
29
20
20
1.98
1658949--1659099
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
1661312--1661337
10
2.6
10
100
0
52
19
11
11
57
1.63
1662337--1662386
22
2.3
22
86
13
68
44
2
0
54
1.11
1680140--1680173
17
2.0
17
100
0
68
41
29
17
11
1.85
1680624--1680648
7
3.6
7
100
0
50
88
0
0
12
0.53
1681268--1681346
26
2.9
28
81
9
92
35
1
0
63
1.03
1681515--1681572
23
2.5
24
83
8
75
48
0
3
48
1.18
1682291--1682333
21
2.0
21
90
0
68
48
6
0
44
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1691441--1691473
14
2.2
16
89
10
52
24
12
3
60
1.46
1699845--1699875
1
31.0
1
100
0
62
100
0
0
0
0.00
1701041--1701067
4
6.8
4
100
0
54
25
22
0
51
1.48
1704151--1704200
24
2.0
25
85
11
68
28
14
16
42
1.86
1712212--1712302
41
2.2
41
98
0
173
21
13
40
24
1.89
1717110--1717134
3
8.3
3
100
0
50
0
32
0
68
0.90
1722447--1722487
19
2.1
20
86
4
57
34
0
2
63
1.08
1723180--1723206
12
2.2
12
100
0
54
18
55
0
25
1.43
1723360--1723406
23
2.0
23
95
0
85
51
4
8
36
1.52
1725217--1725368
72
2.1
72
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1
223
30
23
13
32
1.93
1729823--1729855
17
2.1
16
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11
50
30
0
0
69
0.88
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21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
1729931--1729979
26
2.0
24
88
8
71
32
0
4
63
1.13
1729934--1729992
26
2.3
26
80
8
68
28
0
3
67
1.06
1733299--1733340
12
3.4
12
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50
23
4
4
66
1.30
1739581--1739615
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
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42
2.5
43
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3
151
36
26
21
15
1.93
1741830--1741925
21
4.4
23
84
11
123
37
27
21
13
1.91
1743443--1743497
29
1.9
28
82
10
67
3
18
5
72
1.18
1743442--1743488
22
2.1
23
88
4
69
4
21
4
70
1.22
1743452--1743501
12
4.2
12
80
15
50
6
18
4
72
1.22
1750126--1750155
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1751166--1752138
484
2.0
484
98
0
1894
30
19
11
38
1.87
1757305--1757334
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
1762533--1762578
23
2.0
24
95
4
85
52
15
23
8
1.70
1781752--1781835
23
3.7
23
85
0
114
9
7
36
46
1.64
1785448--1785597
46
3.1
46
75
14
167
30
28
16
26
1.96
1786691--1786743
21
2.5
21
93
0
97
32
24
28
15
1.95
1786677--1786763
21
4.0
23
79
13
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37
24
22
14
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1786953--1787050
28
3.8
23
78
13
70
46
31
4
17
1.66
1786967--1787050
28
3.0
28
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1
132
46
30
3
19
1.66
1815198--1815228
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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