Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  131  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38942553--38942915
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2.2
22
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35
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6
52
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.2
23
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61
2
2
34
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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0
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0
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0
152
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18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39078228--39078513
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1.78
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25
17
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1.97
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137
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0
227
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0
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75
0.91
39085776--39085827
3
16.3
3
84
11
68
30
5
0
63
1.18
39085867--39085905
19
2.0
20
85
5
53
43
7
5
43
1.55
39088080--39088117
5
8.2
5
83
16
55
18
0
0
81
0.69
39088079--39088116
18
2.2
17
95
4
67
21
0
0
78
0.74
39088085--39088109
13
1.9
13
100
0
50
20
0
0
80
0.72
39091785--39091819
18
2.0
18
88
5
54
11
28
45
14
1.79
39092215--39092249
13
2.6
14
86
9
54
20
17
17
45
1.85
39100511--39100550
12
3.5
12
75
25
50
55
2
0
42
1.13
39105762--39105812
19
2.6
20
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12
70
33
1
5
58
1.33
39105762--39105818
19
2.9
19
84
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69
33
1
7
57
1.36
39105985--39106021
18
2.1
18
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0
65
43
18
16
21
1.88
39110560--39110590
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
39111119--39111188
20
3.5
20
75
13
65
5
5
14
74
1.19
39111166--39111202
16
2.3
16
90
0
56
8
0
27
64
1.21
39111164--39111207
17
2.5
17
81
3
52
6
2
22
68
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39111198--39111230
14
2.4
14
90
10
50
0
9
3
87
0.63
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74
3.8
74
88
2
368
28
22
17
31
1.97
39112168--39112924
159
4.9
145
89
5
546
31
22
17
29
1.96
39112123--39112446
74
4.5
72
86
5
345
29
22
16
31
1.96
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71
1.9
71
90
0
214
29
23
16
30
1.96
39112314--39113015
159
4.4
160
96
0
1237
31
22
17
28
1.96
39112631--39112924
71
3.9
71
70
14
237
31
23
16
28
1.96
39118074--39118109
12
3.0
12
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0
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5
25
27
1.77
39120076--39120115
10
4.0
11
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12
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47
0
5
47
1.24
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2
16.5
2
93
0
57
48
0
3
48
1.17
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20
1.9
20
90
10
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7
5
12
75
1.18
39120684--39120728
18
2.5
18
82
7
56
6
2
26
64
1.30
39120719--39120751
14
2.4
14
90
10
50
0
9
3
87
0.63
39121163--39121211
2
25.0
2
87
4
73
46
0
4
48
1.20
39122427--39122470
18
2.4
19
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7
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45
0
0
54
0.99
39123275--39123299
2
12.5
2
100
0
50
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0
0
52
1.00
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3.0
62
80
3
209
30
25
16
27
1.97
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47
2.1
47
83
3
123
21
19
22
35
1.96
39125688--39125754
18
3.6
18
73
11
53
40
5
13
40
1.69
39125678--39125828
39
3.9
39
84
1
196
37
11
14
36
1.82
39125709--39125765
18
2.8
20
69
15
55
42
8
12
36
1.74
39127006--39127064
29
2.0
30
86
3
84
32
6
13
47
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39127919--39127958
20
2.0
20
100
0
80
40
10
10
40
1.72
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3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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17
2.3
18
86
4
55
70
2
2
25
1.13
39141372--39141409
13
3.1
12
82
17
51
39
0
5
55
1.23
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2
20.5
2
100
0
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48
0
0
51
1.00
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48
3.9
48
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1
293
25
20
26
27
1.99
39180536--39180720
98
1.9
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91
2
300
25
20
27
27
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2.0
30
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0
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11
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2.6
11
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5
51
6
10
0
83
0.81
39186999--39187059
22
2.7
22
80
7
70
73
3
11
11
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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