Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  64  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22423051--22423092
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0
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0.00
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0
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0
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0
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0
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2
0
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1.11
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1.65
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0
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0
0
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23
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27
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3.9
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2
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3.1
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5.7
48
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240
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17
31
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
18
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54
2
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156
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10
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2.0
21
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47
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2.4
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23
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0
0
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21
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100
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2.3
11
100
0
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48
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22527210--22527244
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2.1
17
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2
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0
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17
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15
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23
14
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5
36
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0
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1.13
22540209--22540278
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20
2.4
21
84
15
70
57
5
1
34
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22542046--22542135
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5
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0
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35
1.31
22542170--22542228
3
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3
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4
3
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2.0
55
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0
204
24
17
20
37
1.93
22547282--22547432
75
2.0
75
98
0
293
26
24
19
29
1.99
22549529--22549636
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
22556893--22557000
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
22566912--22567002
26
3.5
26
81
11
82
56
5
3
35
1.39
22567030--22567095
20
3.0
22
72
21
57
56
7
1
34
1.37
22567054--22567091
19
2.0
20
89
5
60
60
7
2
28
1.38
22567087--22567176
27
3.2
27
81
10
94
54
5
5
34
1.47
22567158--22567191
14
2.3
15
90
5
52
55
0
8
35
1.31
22567484--22567528
2
22.5
2
86
8
56
55
0
2
42
1.12
22567500--22567639
24
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15
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55
3
5
35
1.39
22567524--22567643
38
3.1
38
71
15
111
55
4
5
35
1.41
22567632--22567778
3
48.0
3
68
15
52
61
4
3
31
1.31
22567689--22567778
28
3.2
26
74
21
76
58
3
4
33
1.34
22567736--22567778
22
2.0
22
86
9
61
65
0
2
32
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22568375--22568409
2
17.0
2
94
5
61
48
0
2
48
1.16
22571739--22571824
43
2.0
43
97
0
163
27
22
4
45
1.72
22580059--22580301
131
1.9
131
88
1
371
34
19
18
27
1.95
22584297--22584332
17
2.1
17
90
10
56
41
11
2
44
1.54
22584465--22584513
14
3.7
14
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15
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51
4
0
44
1.20
22584460--22584510
25
2.0
25
100
0
102
49
3
0
47
1.20
22585800--22585857
29
2.0
30
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3
91
32
18
18
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1.96
22588046--22588096
23
2.2
23
100
0
102
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0
3
56
1.18
22596774--22596921
48
3.1
48
88
0
224
29
24
7
38
1.83
22598188--22598240
27
2.0
27
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3
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39
20
11
28
1.87
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28
3.6
28
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28
30
16
25
1.97
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1.9
58
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1
179
29
28
18
23
1.97
22600579--22600676
29
3.4
28
71
9
81
30
27
19
22
1.98
22600545--22600679
58
2.4
57
83
8
177
28
28
17
25
1.97
22600959--22601091
40
3.3
40
93
1
223
24
30
23
21
1.99
22602513--22602571
28
2.1
28
100
0
118
35
18
10
35
1.85
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3.7
46
73
13
150
31
28
18
21
1.96
22602973--22603058
46
1.9
45
83
4
111
33
27
16
22
1.95
22604333--22604481
40
3.7
40
97
0
280
25
29
22
22
1.99
22608865--22609012
48
3.1
48
86
0
206
30
22
7
39
1.82
22611768--22611847
41
1.9
42
85
7
110
20
26
33
20
1.96
22614107--22614138
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22615756--22615806
15
3.4
14
78
21
59
76
0
1
21
0.88
22619489--22619520
10
3.3
10
95
4
57
62
0
6
31
1.20
22619516--22619576
26
2.3
26
77
2
68
50
11
0
37
1.39
22625034--22625091
30
1.9
30
89
6
91
43
5
10
41
1.61
22625110--22625200
34
2.7
34
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1
121
34
1
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22627017--22627166
75
2.0
75
93
0
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14
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22640942--22641072
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2.0
65
100
0
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100
0
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19
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1.94
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22
2.1
22
100
0
92
39
17
4
39
1.69
22645503--22645676
87
2.0
88
84
3
226
26
21
14
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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