Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  277  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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109
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Period
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Copy
Number
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Score
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43
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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0
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17
3.1
16
75
20
54
50
7
0
41
1.30
84091377--84091443
34
2.0
34
85
5
91
56
5
0
37
1.24
84100127--84100155
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
84106521--84106574
16
3.4
16
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0
72
42
5
24
27
1.76
84106560--84106647
44
2.0
44
86
10
126
34
5
23
36
1.79
84106746--84106898
58
2.5
60
77
12
150
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4
1
42
1.30
84106814--84106853
21
2.0
20
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5
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55
2
0
42
1.13
84106877--84106922
22
2.1
21
88
11
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65
2
0
32
1.05
84107025--84107059
13
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12
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0
11
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1.32
84107826--84107852
5
5.4
5
100
0
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0
18
0
0.69
84114111--84114421
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30
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25
24
1.98
84114205--84114374
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1.8
92
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6
218
28
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24
1.99
84115542--84115583
21
2.0
21
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4
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14
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23
1.93
84117425--84117470
19
2.6
17
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6
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45
13
13
28
1.80
84117419--84117470
17
2.9
17
75
10
59
40
17
17
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
12
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0
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13
1.84
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17
2.0
17
100
0
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29
11
1.90
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19
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20
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15
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1
0
54
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26
3.6
26
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2
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27
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2
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13
1.28
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0
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1.00
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0
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1.96
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3.5
148
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6
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0
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0
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22
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0
37
0
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45
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1.60
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16
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0
0
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1.40
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27
1.40
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4
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0
19
0
0.71
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0
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0
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1.9
18
100
0
70
82
0
17
0
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84172829--84172907
31
2.5
31
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1
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1.57
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2.0
38
94
0
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15
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1.93
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2.2
18
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20
0
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135
26
25
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1.97
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3.5
204
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10
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15
2.9
15
82
0
50
25
18
27
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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