Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  132  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39187050--39187119
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0.91
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30
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0
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1.91
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4
0
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1.22
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5.2
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1
227
33
5
25
36
1.78
39231418--39231552
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2.6
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245
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5
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1.78
39233333--39233615
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2.1
136
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2
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25
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2
0
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0
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0
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23
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19
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3.5
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4.0
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77
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30
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29
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2.5
60
80
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20
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43
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2.0
15
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0
0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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22
17
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2.5
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14
23
33
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234
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14
21
37
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199
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583
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21
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17
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52
0
5
42
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39314909--39314951
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21
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25
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0
0
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1.66
39323298--39323369
37
2.1
34
80
14
78
44
12
5
37
1.66
39327180--39327244
29
2.2
29
97
0
121
18
15
36
29
1.91
39327813--39327851
20
2.0
20
84
0
51
33
15
17
33
1.92
39330494--39330548
25
2.2
25
84
12
78
56
5
0
38
1.23
39332354--39332410
25
2.3
25
84
6
71
50
3
17
28
1.62
39333276--39333313
20
1.9
20
88
0
58
10
36
31
21
1.87
39337671--39337790
59
2.0
59
100
0
240
22
18
35
23
1.95
39337730--39337957
48
4.9
47
82
3
259
27
17
31
24
1.97
39340082--39340128
3
15.7
3
100
0
94
34
0
0
65
0.93
39340938--39340971
3
11.3
3
100
0
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0
0
64
0.94
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3
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3
100
0
58
31
0
0
68
0.89
39343835--39343883
21
2.4
20
89
3
71
44
30
0
24
1.54
39345738--39345798
32
1.9
32
83
6
79
36
9
18
36
1.84
39345882--39345937
18
3.1
19
85
12
73
55
7
0
37
1.27
39345895--39345958
34
1.9
33
83
3
83
53
4
0
42
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39351280--39351331
20
2.5
21
81
3
61
57
5
3
32
1.40
39352138--39352189
27
1.9
27
84
7
70
44
0
3
51
1.19
39352385--39352420
18
2.1
17
89
5
54
61
0
0
38
0.96
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107
2.3
107
100
0
498
44
4
6
44
1.49
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16
1.9
17
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50
0
0
50
1.00
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7
4.0
7
100
0
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42
0
0
57
0.99
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25
2.0
25
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7
75
32
14
20
34
1.92
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3
110.0
3
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13
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1.36
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26
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13
101
64
2
2
29
1.21
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2.9
22
73
23
57
44
2
2
49
1.32
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46
10.7
46
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7
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36
15
24
23
1.93
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5.5
84
89
5
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35
15
24
24
1.94
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130
3.9
127
86
8
616
36
15
24
23
1.94
39383076--39383557
176
2.8
175
91
3
771
35
15
24
24
1.94
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25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
39385952--39386011
3
20.0
3
89
0
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1
30
0
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0.99
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6
5.3
6
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13
50
0
14
2
82
0.79
39397683--39397757
24
3.0
25
83
11
84
48
1
1
49
1.18
39398586--39398632
20
2.3
21
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60
68
2
29
0
1.02
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53
2.8
53
88
4
205
29
27
16
26
1.97
39408521--39408564
18
2.5
18
85
3
54
70
6
4
18
1.27
39408798--39408849
22
2.3
22
86
3
68
57
3
0
38
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39409958--39410001
22
2.0
21
91
4
70
6
22
25
45
1.77
39414224--39414471
50
4.9
50
85
1
316
29
26
18
25
1.98
39414235--39414468
101
2.3
100
88
0
333
29
26
18
25
1.98
39418974--39419030
13
4.6
13
76
12
57
42
38
1
17
1.60
39419028--39419064
16
2.3
16
90
0
56
75
2
0
21
0.92
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17
3.4
17
68
12
50
31
4
14
49
1.65
39422754--39422831
37
2.1
36
95
2
138
33
7
14
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1.73
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9
3.4
9
95
0
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32
9
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1.75
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15
75
11
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70
1
24
3
1.12
39424934--39425005
29
2.5
29
86
8
94
37
1
25
36
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335