Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  288  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86814921--86815004
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0
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0
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20
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20
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1.99
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44
2.0
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176
26
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38
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2.1
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36
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27
20
25
1.99
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2.0
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20
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2.5
82
87
0
297
28
27
19
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2.9
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100
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86856924--86857005
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100
0
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7
26
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130
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2.0
80
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23
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0
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2.6
176
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530
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30
1.98
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2.3
133
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22
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29
1.99
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2.0
64
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177
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1.9
130
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319
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0
0
50
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5
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1.25
86883562--86883627
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3.3
20
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40
6
0
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1.26
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25
0
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0
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3
82
0
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2
6
29
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.31
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36
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30
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21
2.5
18
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13
60
68
0
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29
1.02
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10
184
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22
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1.95
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1.96
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210
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16
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16
28
1.96
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119
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1.94
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152
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5
1
60
1.28
86915304--86915382
36
2.3
34
82
8
97
32
5
2
59
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86915390--86915472
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4.9
17
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57
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3
2
62
1.25
86915417--86915455
12
3.4
11
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3
51
30
0
2
66
1.05
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51
19
2
6
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1.18
86915593--86915634
2
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2
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0
0
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0
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35
1.79
86927109--86927265
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2.5
64
95
0
296
37
21
6
35
1.79
86932103--86932131
12
2.4
12
100
0
58
13
51
27
6
1.66
86933715--86933767
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
86935245--86935401
32
4.9
32
94
3
280
37
22
7
32
1.81
86937758--86937865
44
2.4
45
78
4
112
30
20
21
27
1.98
86937844--86938261
44
9.4
43
68
7
156
28
21
22
27
1.99
86937847--86938049
88
2.3
88
93
0
343
28
20
25
26
1.99
86937935--86938279
135
2.6
135
84
1
435
30
20
22
26
1.98
86937935--86938318
135
2.9
133
80
3
414
30
20
22
26
1.98
86940269--86940301
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
86940644--86940942
126
2.4
126
89
4
433
24
16
21
38
1.92
86943033--86943075
11
4.0
11
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6
61
20
46
4
27
1.71
86943033--86943074
21
2.0
22
90
4
68
21
47
2
28
1.63
86943613--86943663
18
2.8
18
84
0
66
37
23
5
33
1.79
86947727--86947769
11
4.0
11
81
6
52
20
48
4
25
1.69
86956709--86956818
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86958310--86958362
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
86958610--86958896
137
2.1
137
92
1
477
25
17
24
32
1.97
86959704--86959756
28
1.9
27
88
3
79
24
26
20
28
1.99
86959681--86959825
61
2.3
60
82
8
159
26
25
20
27
1.99
86959858--86959901
19
2.2
20
84
4
54
34
20
18
27
1.96
86965726--86965952
111
2.0
111
99
0
445
32
12
12
42
1.80
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21
2.3
19
79
17
56
73
8
0
17
1.08
86969544--86969584
21
2.0
21
90
4
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73
7
0
19
1.07
86969528--86969584
20
2.8
21
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12
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70
7
0
22
1.11
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5.3
40
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5
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24
27
21
26
1.99
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39
5.3
40
85
6
277
24
27
21
26
1.99
86974302--86974491
79
2.4
79
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3
267
24
28
21
25
1.99
86982323--86982531
39
5.3
40
83
6
250
24
26
21
27
1.99
86982313--86982531
79
2.8
78
82
7
248
23
26
21
27
1.99
86990211--86990421
40
5.3
40
82
5
241
24
26
21
27
1.99
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3.6
40
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2
216
25
22
26
25
2.00
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21
2.3
19
88
7
63
28
2
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60
1.39
86997473--86997535
17
3.3
19
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20
51
34
4
4
55
1.42
86997558--86997627
25
2.8
25
80
6
61
35
10
4
50
1.56
86997579--86997627
25
2.0
25
87
0
71
34
14
6
44
1.70
86997655--86997763
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2.1
53
98
0
209
34
3
10
51
1.53
86997684--86997768
24
3.3
24
68
25
75
34
3
9
52
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86997785--86997880
49
2.0
48
82
13
117
31
10
6
52
1.60
86999839--86999879
18
2.3
18
87
8
57
4
0
29
65
1.13
87002752--87002790
15
2.7
14
84
15
53
74
0
2
23
0.94
87004848--87005022
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1.9
92
83
4
228
32
20
22
24
1.98
87005453--87005521
21
3.2
21
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11
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20
26
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20
1.97
87006263--87006320
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2.4
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0
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13
0.79
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6.1
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0
0
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0
0
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2.1
25
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83
0
1
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0.74
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2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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