Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  31  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11381340--11381399
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32
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6
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10
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1.75
11382266--11382310
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2.4
18
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1.17
11382616--11382674
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2.4
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37
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11
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11382611--11382668
26
2.2
26
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41
6
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1.62
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4.5
46
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201
26
19
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22
1.98
11388740--11388797
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2.1
28
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24
10
12
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2.1
50
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203
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40
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146
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15
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24
1
3
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1.10
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293
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380
29
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0
32
0
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34
0
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0.93
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0
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70
20
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0
33
1
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1.02
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2.3
18
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4
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9
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2.5
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81
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0
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1.9
19
94
0
65
45
0
2
51
1.15
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18
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10
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43
0
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1.16
11414765--11414802
19
2.1
18
90
5
58
36
0
5
57
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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11423212--11423273
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2.0
32
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0
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32
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1.9
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40
0
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56
1.15
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2.1
17
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0
0
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42
0
2
55
1.13
11445762--11445813
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2.2
24
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61
44
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1.75
11461331--11461372
18
2.4
18
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11
52
42
4
2
50
1.36
11462128--11462171
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2.4
19
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11462725--11462773
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2.2
23
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34
6
2
57
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2.2
21
84
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0
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0
0
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2.5
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1
52
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2.0
42
100
0
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9
35
1.56
11502724--11502769
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2.0
24
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0
6
52
1.27
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2.8
53
89
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214
25
16
27
29
1.97
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53
2.8
53
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214
25
16
27
29
1.97
11522789--11522957
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3.1
54
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220
26
15
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2.5
12
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10
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33
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2.0
111
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13
34
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2.6
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18
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62
0
0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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64
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0
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21
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2.2
25
93
0
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37
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30
1.90
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0
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36
14
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1.9
22
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13
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85
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1
1
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1.20
11629241--11629309
31
2.2
32
82
7
79
57
5
2
33
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11629263--11629327
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2
103
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22
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22
0
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1.52
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0
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1.10
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0
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106
23
16
27
32
1.96
11634892--11634940
20
2.5
20
76
6
55
28
0
10
61
1.29
11635048--11635087
19
2.1
20
90
9
66
47
0
2
50
1.14
11636629--11636674
15
3.1
15
87
3
67
52
0
6
41
1.27
11637744--11637777
12
2.9
12
86
4
52
32
0
0
67
0.91
11637900--11637961
30
2.1
30
93
0
106
59
11
0
29
1.32
11640643--11640694
26
2.0
25
88
3
77
48
3
7
40
1.50
11640952--11640990
20
2.0
21
85
10
55
64
0
5
30
1.15
11647955--11647985
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
11649678--11649724
16
2.8
17
81
9
53
14
6
6
72
1.25
11651699--11652054
193
1.8
193
87
0
523
25
26
14
32
1.95
11652973--11653021
20
2.5
20
80
6
55
30
2
6
61
1.32
11656528--11656694
46
3.5
46
75
12
156
28
28
16
25
1.97
11657758--11657853
42
2.2
44
83
7
126
38
26
21
13
1.91
11657758--11657865
21
5.0
23
82
10
113
37
24
22
15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11658848--11658915
22
3.0
22
81
10
84
41
19
23
16
1.90
11660645--11660707
23
2.7
23
100
0
126
44
34
4
15
1.68
11660645--11660738
23
3.9
23
84
13
116
44
34
4
17
1.68
11660659--11660794
29
5.0
28
89
5
183
47
30
3
19
1.66
11663190--11663231
21
2.0
21
85
0
57
42
16
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33
1.75
11665267--11665310
21
2.1
21
87
4
63
50
2
0
47
1.13
11669936--11669975
20
2.0
21
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5
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40
15
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15
1.87
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3
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3
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30
0
3
1.06
11672916--11672950
15
2.3
15
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0
52
17
37
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34
1.85
11674803--11674848
21
2.2
21
88
7
67
34
0
2
63
1.07
11676845--11676970
64
2.0
64
95
0
225
37
2
18
42
1.63
11679638--11679760
65
1.9
65
85
6
169
39
5
10
43
1.63
11686855--11686960
18
5.9
18
63
19
51
39
0
1
58
1.09
11690336--11690395
17
3.5
17
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17
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8
11
1
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1.03
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16
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17
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12
6
3
77
1.09
11690625--11690651
14
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14
100
0
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0
0
55
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3.5
37
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13
115
39
0
2
57
1.17
11690610--11690651
21
1.9
23
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9
61
45
0
0
54
0.99
11690775--11690821
20
2.4
19
83
16
60
70
0
8
21
1.14
11690872--11690898
14
1.9
14
100
0
54
55
0
0
44
0.99
11690896--11690933
13
2.8
14
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8
51
60
0
2
36
1.11
11690877--11691011
36
3.9
35
77
9
125
57
2
0
39
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11690917--11690963
23
2.0
24
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4
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61
4
0
34
1.15
11690981--11691028
21
2.2
22
85
10
64
52
4
0
43
1.20
11691106--11691139
13
2.6
13
85
0
50
76
0
11
11
1.02
11691126--11691179
28
1.9
28
96
0
99
77
0
12
9
0.98
11691126--11691179
17
3.5
17
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27
57
77
0
12
9
0.98
11695286--11695315
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2.0
15
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0
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26
1.35
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3
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3
100
0
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0
0
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0.90
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2
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4
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45
1.45
11703850--11703886
19
2.1
18
90
10
58
45
0
5
48
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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