Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Percent
Indels
Score
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196
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23
10
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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(0-2)
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53
85
2
187
29
26
17
26
1.98
13483469--13483512
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2.4
18
96
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29
1.91
13485354--13485401
13
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13
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13
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25
0
43
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13485516--13485650
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38
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8
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28
28
20
23
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13485889--13485927
18
2.1
19
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4
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10
0
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5
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1
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1
0
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1.10
13491823--13491858
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2.8
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0
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53
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2
205
29
27
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25
1.97
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51
2.3
51
80
0
133
41
12
6
39
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
133
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12
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39
1.68
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0
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0
0
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0
0
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22
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2
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0
0
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0
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1.00
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1.54
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1
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1.10
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29
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1
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2.7
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0
0
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27
15
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47
4.0
48
80
6
185
30
28
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13567827--13567960
53
2.5
53
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2
207
28
27
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26
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0
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0
0
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2.3
24
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15
60
52
7
1
38
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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