Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  314  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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92721917--92722026
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20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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44
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20
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21
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21
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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22
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
92799084--92799153
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0
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29
1.95
92821040--92821191
37
3.9
37
87
5
178
24
29
15
30
1.96
92824716--92824776
28
2.2
30
77
19
69
31
18
6
44
1.75
92825159--92825201
18
2.5
17
85
7
59
32
6
0
60
1.23
92827209--92827254
21
2.2
20
85
11
58
69
4
13
13
1.33
92827214--92827254
20
2.1
19
86
13
57
68
4
12
14
1.36
92827573--92827604
17
1.9
16
93
6
55
62
0
0
37
0.95
92828242--92828330
46
2.0
45
82
10
110
28
23
11
37
1.89
92828353--92828432
34
2.4
34
83
8
101
17
16
20
46
1.84
92828646--92828696
20
2.7
19
73
8
50
47
15
0
37
1.46
92828916--92828984
36
1.9
36
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0
93
27
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1.98
92829034--92829063
15
2.0
15
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30
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20
33
1.94
92829012--92829084
36
2.0
37
89
2
112
30
17
20
31
1.96
92831281--92831312
15
2.1
15
100
0
64
68
6
6
18
1.32
92831408--92831475
29
2.3
29
82
0
82
29
26
23
20
1.99
92832762--92832828
31
2.2
31
88
0
98
26
26
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92832786--92832873
46
1.9
45
86
2
122
27
21
22
28
1.99
92832869--92832995
50
2.5
51
90
1
193
28
22
14
34
1.93
92839751--92839797
3
15.7
3
100
0
94
65
0
0
34
0.93
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20
2.1
20
86
0
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2
19
19
59
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15
2.1
15
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0
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9
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50
12
1.71
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351
1.9
338
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6
901
27
14
16
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1.87
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44
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2
140
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13
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27
1.92
92856063--92856196
46
3.0
45
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4
135
35
14
23
26
1.93
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19
1.9
19
100
0
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13
21
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3
92
0
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35
0
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35
1.58
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20
2.0
20
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5
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39
2
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44
1.57
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21
3.5
19
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25
53
28
0
2
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1.02
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10
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10
70
24
68
36
1
0
62
1.03
92881811--92881888
19
4.1
19
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35
0
0
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2.0
25
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0
0
68
0.90
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1
0
62
1.02
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2.0
18
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30
0
2
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1.06
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2.9
23
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25
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51
1
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1.51
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20
2.0
20
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60
10
0
28
1.30
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2
19.5
2
100
0
78
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0
0
48
1.00
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23
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60
6
1
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1.31
92884852--92884904
3
17.7
3
100
0
106
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92885527--92885551
2
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2
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0
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0
0
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1.00
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3
100
0
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0
0
66
0.92
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13.8
6
81
0
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25
0
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27
1.53
92898633--92898715
12
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12
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5
114
25
0
46
27
1.53
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29
2.4
28
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13
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60
2
1
35
1.21
92920773--92920812
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2.0
20
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47
5
0
47
1.24
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4.2
26
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0
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1.83
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4.2
26
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2
180
32
7
23
36
1.83
92932817--92932923
51
2.1
52
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1
189
32
7
23
36
1.83
92940391--92940444
21
2.7
20
80
16
58
57
3
7
31
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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