Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  25  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9274263--9274316
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0
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0
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17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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20
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1.25
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2.9
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1
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5
14
40
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
23
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1.92
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
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28
28
1.94
9529831--9529893
28
2.2
28
83
5
74
36
7
25
30
1.84
9529966--9530149
39
4.7
39
93
1
314
18
22
29
29
1.97
9532615--9532689
37
2.0
37
97
0
141
24
25
17
33
1.96
9546580--9546615
18
2.0
18
100
0
72
50
22
5
22
1.70
9546720--9546767
24
2.0
24
100
0
96
54
0
12
33
1.38
9546720--9546760
13
3.3
13
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13
50
51
0
14
34
1.43
9549558--9549598
16
2.6
16
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17
50
58
2
2
36
1.24
9557704--9557739
18
1.9
18
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5
54
27
0
2
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1.02
9559323--9559352
10
3.0
10
100
0
60
40
0
0
60
0.97
9559286--9559352
20
3.4
20
73
22
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38
5
0
55
1.25
9560054--9560105
23
2.2
24
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3
79
11
17
17
53
1.72
9561614--9562218
90
6.7
90
92
0
933
29
17
30
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9563499--9563591
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2.0
47
100
0
186
37
25
6
30
1.81
9569863--9570109
123
2.0
123
100
0
494
41
11
18
28
1.85
9577949--9578189
42
5.7
42
88
1
358
22
33
10
33
1.89
9579090--9579135
24
1.9
24
86
0
65
43
0
0
56
0.99
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13
2.3
15
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28
0
3
68
1.04
9581707--9581778
24
3.2
24
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18
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26
0
22
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1.48
9581687--9581779
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2.1
43
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2
168
29
0
21
49
1.50
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15
2.3
15
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18
0
40
1.51
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2.4
44
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3
135
28
23
14
33
1.94
9587101--9587142
3
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3
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18
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2
0
35
1.09
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7
10.1
7
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14
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56
2
0
40
1.13
9587089--9587142
10
5.1
10
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8
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62
1
0
35
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14
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0
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0
0
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0.99
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2.5
16
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0
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5
2
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0
0
50
1.00
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14
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27
25
0
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1.52
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18
2.2
19
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24
0
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1.53
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28
28
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23
1.99
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18
2.1
19
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4
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48
10
0
41
1.37
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10.0
5
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0
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4.5
12
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1
0
42
1.10
9615774--9615809
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9615761--9615801
18
2.2
19
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12
59
29
24
0
46
1.53
9615924--9616058
39
3.4
38
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8
101
28
28
20
23
1.99
9616298--9616336
18
2.1
19
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4
62
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10
0
41
1.37
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5
10.0
5
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55
1
0
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1.10
9617653--9617705
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2.5
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1
0
43
1.11
9617650--9617705
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53
1
0
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30
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0
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0
1.00
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28
20
21
1.98
9659015--9659188
46
3.8
46
74
10
138
30
28
19
21
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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