Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  151  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
23
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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25
27
1.99
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63
3.1
62
80
3
179
28
19
26
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44532985--44533195
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2.0
108
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1.97
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2.1
52
100
0
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11
18
32
1.86
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2.3
52
94
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197
36
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18
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29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
44571090--44571175
21
4.1
21
86
0
100
36
25
22
16
1.94
44572609--44572644
15
2.3
17
81
18
51
0
30
0
69
0.89
44577670--44577712
18
2.5
17
78
17
52
18
25
6
48
1.73
44578964--44579049
21
4.1
21
86
0
100
36
25
22
16
1.94
44580485--44580515
15
2.0
16
93
6
55
0
25
0
74
0.82
44582245--44582317
7
10.4
7
85
5
85
15
27
9
47
1.76
44584825--44584869
22
2.1
22
87
4
65
44
0
24
31
1.54
44585240--44585278
2
19.5
2
94
0
69
51
2
0
46
1.14
44586245--44586326
41
2.0
41
97
0
155
35
17
21
25
1.95
44587172--44587200
14
2.0
15
93
6
51
58
0
0
41
0.98
44588521--44588785
26
10.2
26
75
9
229
61
3
6
29
1.35
44588521--44588863
26
13.6
24
70
18
168
60
2
6
30
1.37
44588521--44588785
50
5.1
51
77
13
191
61
3
6
29
1.35
44588521--44588785
76
3.4
75
74
15
216
61
3
6
29
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44588521--44588785
103
2.5
108
77
12
257
61
3
6
29
1.35
44588622--44588784
27
6.1
27
73
15
103
62
2
5
29
1.30
44601395--44601713
46
7.0
46
87
4
430
41
14
23
21
1.89
44601398--44601708
137
2.3
138
89
2
466
41
14
23
20
1.89
44601994--44602026
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
44605821--44605853
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
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7
4.0
7
100
0
56
0
14
0
85
0.59
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7
3.6
7
100
0
50
12
28
0
60
1.32
44622643--44622675
11
3.1
11
95
4
59
39
0
0
60
0.97
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18
2.6
18
80
16
58
66
13
0
20
1.24
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30
1.9
30
85
0
80
56
8
6
27
1.55
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22
2.0
22
85
0
59
58
9
11
20
1.61
44622896--44622936
11
3.7
11
80
0
55
56
7
14
21
1.63
44628774--44628812
18
2.1
19
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4
53
43
15
12
28
1.83
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21
2.6
21
79
5
65
35
7
24
33
1.83
44635064--44635105
20
2.1
20
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0
57
28
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19
42
1.82
44640239--44640280
23
1.9
21
85
9
57
35
0
16
47
1.47
44640251--44640280
10
2.9
10
95
5
51
36
0
13
50
1.42
44641158--44641183
12
2.2
12
100
0
52
34
0
15
50
1.45
44641364--44641390
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
44641679--44641735
20
2.8
20
72
15
55
17
24
15
42
1.88
44647582--44647618
14
2.8
14
84
8
51
64
0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44647822--44647856
17
2.1
17
88
0
52
54
5
0
40
1.24
44648226--44648325
35
2.9
35
82
4
123
39
17
23
21
1.92
44651704--44651782
20
4.0
20
83
8
99
55
2
1
40
1.21
44651704--44651782
39
2.0
39
85
4
106
55
2
1
40
1.21
44651709--44651791
19
4.3
19
84
7
80
57
1
1
39
1.14
44651704--44651789
38
2.2
39
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6
104
56
2
1
39
1.19
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3
11.7
3
100
0
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0
0
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0.90
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0
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1.94
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2.0
31
100
0
124
54
22
3
19
1.58
44666899--44667223
49
6.7
47
78
10
255
23
29
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335