Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  310  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91845811--91845918
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4.2
26
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0
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0
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0
0
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0
0
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1.00
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5.7
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5
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91860467--91860568
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3.1
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5
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0
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5
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2.3
70
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20
41
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1
1392
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16
20
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1.93
91877213--91877976
279
2.7
280
96
1
1392
25
16
20
37
1.93
91877815--91877848
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2.5
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1.8
120
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4.7
75
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31
17
19
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1.8
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27
21
19
32
1.97
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1.9
164
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5
443
28
19
19
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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3.3
238
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19
34
1.94
91878748--91878809
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2.1
30
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19
9
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1.83
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1.9
25
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4
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71
20
4
4
1.19
91879631--91879689
26
2.3
26
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23
5
3
1.26
91880439--91880537
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5
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91881292--91881332
3
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3
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0
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2
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52
1.51
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0
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45
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2.0
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2.0
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100
0
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100
0
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3.7
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80
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62
33
21
15
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1.94
91911292--91911360
29
2.3
30
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2
95
31
23
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1.95
91911290--91911372
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53
32
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1.94
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1.9
92
94
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311
27
20
23
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2.0
36
100
0
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2.6
27
76
14
69
28
13
8
50
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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2.0
16
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0
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1.9
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2
26
1.30
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0
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0
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0
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17
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1.95
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1474
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17
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5.1
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14
50
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0
87
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91950610--91950674
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4
31
1.34
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14
3.2
14
83
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59
4
2
34
1.30
91954947--91955080
56
2.3
58
79
11
134
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3
5
32
1.40
91955438--91955481
8
5.6
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5
54
54
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0
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0
0
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12
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40
100
0
162
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4
12
9
1.25
91961133--91961197
19
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19
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4
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12
7
50
1.67
91961118--91961192
37
2.0
37
100
0
150
33
13
8
45
1.72
91961672--91961714
22
2.0
22
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48
9
0
41
1.35
91963134--91963172
20
2.0
20
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10
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33
5
2
58
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28
2.1
28
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3
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1.24
91965732--91965780
24
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24
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0
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23
2.0
23
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0
72
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0
2
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3
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0
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0
0
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0.92
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2
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10
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1.10
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29
2.0
29
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0
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1.13
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9
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16
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38
0
4
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1.26
91971264--91971395
19
7.0
18
70
15
63
39
0
4
55
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91971270--91971348
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15
76
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1.30
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9
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9
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13
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1
5
58
1.27
91971299--91971388
10
9.3
10
74
10
53
36
1
5
56
1.30
91971316--91971388
30
2.5
28
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8
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1
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14
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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1.00
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48
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2.1
23
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21
0
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2.2
13
100
0
58
20
0
0
79
0.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92032825--92032874
22
2.3
23
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2
2
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1.18
92032825--92032881
22
2.6
22
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1
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2.0
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2.2
51
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0
210
33
13
23
29
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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