Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  41  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14955225--14955309
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43
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4
118
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2.0
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0
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0
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0
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2.4
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1.68
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4.1
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61
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2
2
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1.24
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0
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30
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0
0
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2.4
47
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35
23
16
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15034014--15034124
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2.4
47
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154
35
23
16
25
1.95
15041176--15041213
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2.1
19
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18
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0
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1.45
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2.0
20
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0
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0
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0
0.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.44
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2.3
27
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43
1
3
51
1.27
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2.3
45
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131
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20
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0
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0
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11
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1.63
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18
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19
2.0
20
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38
2
7
51
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15194082--15194317
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2.0
17
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5
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1.54
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91
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17
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15
22
25
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15197179--15197414
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25
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2.0
25
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19
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1.94
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2.3
42
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3
133
34
13
22
29
1.92
15200754--15200807
3
18.0
3
100
0
108
33
0
0
66
0.92
15202447--15202472
13
2.0
13
100
0
52
0
23
0
76
0.78
15204798--15204835
19
2.0
19
100
0
76
52
0
5
42
1.24
15205153--15205180
13
2.2
13
100
0
56
75
0
25
0
0.81
15210095--15210223
50
2.5
51
88
2
188
34
15
22
27
1.94
15210129--15210240
51
2.4
45
75
16
109
35
15
24
25
1.94
15210199--15210471
31
8.8
31
88
4
408
27
19
27
25
1.99
15210199--15210471
62
4.4
62
93
0
474
27
19
27
25
1.99
15210500--15210709
47
4.5
48
78
10
181
29
13
27
30
1.94
15210639--15210755
42
2.8
42
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5
155
32
12
25
29
1.93
15213039--15213167
46
2.8
46
91
0
195
20
20
27
30
1.98
15215408--15215558
53
2.8
53
88
4
205
26
16
27
29
1.97
15227687--15228039
89
4.1
87
77
9
337
33
21
23
21
1.97
15227689--15228032
87
4.0
88
78
7
335
33
21
23
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15227861--15228023
81
2.0
82
87
1
238
30
20
25
23
1.99
15228042--15228157
45
2.6
45
80
4
146
31
21
21
25
1.98
15228142--15228171
14
2.1
14
93
0
51
26
13
40
20
1.89
15229779--15229820
20
2.2
19
83
12
50
28
7
7
57
1.52
15229954--15229992
19
2.0
20
85
5
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38
2
7
51
1.44
15230013--15230042
15
2.1
14
93
6
51
33
6
0
60
1.23
15230563--15230810
128
1.9
129
89
0
381
28
17
18
35
1.94
15231351--15231407
21
2.9
19
75
12
62
47
0
3
49
1.18
15233094--15233458
46
8.0
46
87
1
448
41
13
23
21
1.89
15233094--15233476
137
2.8
138
82
5
472
41
13
22
21
1.88
15235756--15235794
17
2.3
17
86
8
53
30
0
20
48
1.50
15247577--15247742
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
15247577--15247747
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
15255049--15255214
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
15255049--15255219
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
15256691--15256915
46
4.9
46
89
3
294
22
23
13
40
1.89
15258111--15258276
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
15258111--15258281
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
15265582--15265747
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
15265582--15265752
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
15267227--15267453
46
4.9
46
90
1
303
22
23
13
41
1.88
15269508--15269555
11
4.2
11
79
10
60
64
0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15269502--15269557
24
2.3
24
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3
76
60
1
0
37
1.07
15280242--15280322
40
2.0
41
95
2
146
32
9
16
41
1.81
15288861--15288887
6
4.5
6
100
0
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18
33
29
18
1.95
15297322--15297355
5
6.8
5
100
0
68
0
41
0
58
0.98
15297322--15297363
15
2.8
15
92
0
57
0
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2
59
1.10
15307302--15307342
15
2.7
16
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11
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34
34
7
24
1.83
15308731--15308758
5
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5
100
0
56
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0
0
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20
27
28
1.99
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13
2.8
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16
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27
25
0
47
1.52
15314961--15315001
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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