Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  61  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21397993--21398047
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3
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36
0
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1.05
21401232--21401346
21
5.2
21
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3
2
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2.5
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29
11
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1.44
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2.5
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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1
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21
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1
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3.2
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2.3
29
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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30
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0
100
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0
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21
20
21
37
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21506056--21506210
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20
20
21
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0
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0
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0
1
46
1.10
21525163--21525247
21
4.2
21
70
22
67
54
0
0
45
1.00
21525196--21525291
27
3.6
28
73
18
80
57
2
0
40
1.10
21537926--21538000
37
2.0
38
97
2
143
34
2
16
46
1.61
21538926--21539211
132
2.2
131
92
1
475
29
12
11
46
1.77
21540053--21540081
6
4.8
6
100
0
58
17
0
0
82
0.66
21540753--21540804
15
3.3
15
76
15
52
25
0
7
67
1.17
21540888--21540924
18
2.1
18
94
0
65
27
18
18
35
1.95
21547806--21547868
24
2.7
23
76
11
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61
1
0
36
1.05
21549023--21549081
18
3.2
18
77
13
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45
1
3
49
1.28
21549032--21549102
13
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17
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46
1
2
49
1.25
21562544--21562605
30
2.1
30
93
6
108
32
14
14
38
1.86
21564954--21565073
42
2.8
42
80
5
134
27
23
17
31
1.97
21574415--21574441
14
1.9
14
100
0
54
59
0
0
40
0.98
21579058--21579110
24
2.2
24
96
0
97
18
7
28
45
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21579756--21579808
2
26.5
2
100
0
106
50
0
0
49
1.00
21580823--21580871
26
2.0
24
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8
71
61
8
0
30
1.25
21580852--21580890
19
2.0
20
90
5
62
69
10
2
17
1.28
21581609--21581670
23
2.8
22
75
18
65
62
1
1
33
1.14
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15
2.5
16
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4
53
58
0
0
41
0.98
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44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
21593041--21593148
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2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
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17
1.9
17
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11
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75
0
3
21
0.93
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122
2.1
122
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0
478
29
12
13
44
1.80
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50
2.5
51
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7
183
35
16
22
25
1.94
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31
4.7
31
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3
193
28
21
25
24
1.99
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62
2.4
62
88
2
219
28
20
26
24
1.99
21631100--21631214
42
2.7
42
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4
142
30
14
25
29
1.95
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17
1.9
18
88
5
52
41
0
23
35
1.55
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13
2.9
14
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7
55
62
0
10
27
1.27
21635330--21635411
21
3.9
21
82
4
85
18
23
21
36
1.95
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44
2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
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44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
21648347--21648373
6
4.5
6
100
0
54
0
14
0
85
0.61
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6
6.3
6
100
0
76
34
0
50
15
1.45
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11
2.4
11
100
0
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0
0
23
0.78
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19
4.8
19
71
13
60
27
1
4
67
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21668415--21668449
16
2.2
16
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0
61
31
0
0
68
0.90
21671825--21671902
31
2.5
31
83
4
95
25
19
12
42
1.87
21680354--21680386
6
5.7
6
89
7
50
84
3
0
12
0.72
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58
3.1
59
78
7
152
28
15
15
40
1.88
21689795--21689931
58
2.4
57
83
3
159
29
16
16
37
1.91
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26
2.2
26
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0
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8
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2.0
56
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208
20
12
16
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2
4
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1.21
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17
2.0
18
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34
11
8
45
1.71
21720034--21720087
19
2.6
20
77
11
56
40
1
5
51
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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