Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  69  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23654883--23655056
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46
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20
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0
0
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1.08
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2
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2
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2
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2.0
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1
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25
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1
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0
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0
0
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0
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77
0
0
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6.5
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79
12
54
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5
1
83
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23731448--23731495
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17
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4
2
66
1.21
23731482--23731574
23
4.1
22
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12
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45
0
1
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199
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1
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55
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27
2.5
26
82
5
78
51
3
1
43
1.26
23732064--23732126
26
2.4
27
83
2
74
50
3
1
44
1.27
23732161--23732212
17
3.1
16
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1
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80
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2.1
21
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41
0
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1.20
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21
2.1
21
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18
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2.0
39
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0
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9
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3.1
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56
45
0
5
49
1.26
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1.9
25
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4
62
53
0
4
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1.20
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4.5
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0
56
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38
0
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1.30
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2
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2
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40
0
7
52
1.29
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2.3
31
87
0
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29
9
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42
1.82
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40
2.1
40
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116
29
8
20
41
1.81
23771410--23771508
45
2.2
45
87
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137
22
19
17
41
1.90
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61
2.6
59
89
3
229
38
10
16
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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0
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0.98
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21
83
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52
0
0
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1.00
23778844--23778884
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2.3
18
91
8
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53
0
0
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1.00
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20
0
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1.9
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28
0
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1.37
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0
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28
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1.94
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23
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1
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15
22
26
1.94
23795023--23795298
99
2.8
100
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1
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35
15
22
26
1.94
23795023--23795298
149
1.8
150
93
0
482
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15
22
26
1.94
23795278--23795336
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1.9
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100
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25
25
1.99
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2.4
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22
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25
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21
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0
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20
3.1
20
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0
106
14
14
17
53
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23848429--23848462
13
2.7
13
90
4
52
32
2
0
64
1.08
23849320--23849372
20
2.7
19
80
5
61
33
3
1
60
1.26
23854931--23854989
21
2.8
22
85
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70
23
0
6
69
1.12
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2.4
24
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28
0
3
68
1.05
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4.0
16
75
19
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53
4
0
41
1.22
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37
1.9
37
85
8
99
54
5
1
38
1.33
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27
2.1
27
90
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87
37
3
3
55
1.35
23884760--23884821
30
2.1
30
90
6
99
56
6
3
33
1.41
23884854--23884896
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
23885381--23885439
12
4.9
12
72
15
59
49
0
1
49
1.11
23885381--23885452
24
2.9
24
80
12
67
51
0
1
47
1.09
23885393--23885448
16
3.4
16
80
9
51
51
0
1
46
1.11
23885413--23885452
12
3.1
13
82
10
55
57
0
0
42
0.98
23888969--23888997
4
7.2
4
100
0
58
48
24
0
27
1.51
23889656--23889683
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
23892004--23892058
26
2.1
27
83
10
69
61
5
0
32
1.19
23892967--23893071
26
4.3
25
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18
78
32
1
3
61
1.24
23896929--23896959
16
1.9
16
100
0
62
38
9
25
25
1.86
23897210--23897277
19
3.4
19
78
13
75
51
0
1
47
1.09
23921801--23921844
17
2.6
17
96
0
79
2
6
45
45
1.42
23922928--23922952
7
3.6
7
100
0
50
28
60
12
0
1.32
23932123--23932176
25
2.2
25
100
0
108
48
22
3
25
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23932231--23932261
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
23934665--23934704
19
2.2
19
86
4
55
50
10
0
40
1.36
23937412--23937541
61
2.1
61
98
0
251
44
8
7
39
1.64
23941959--23942016
22
2.6
22
83
2
62
68
5
6
18
1.31
23942278--23942329
22
2.3
22
83
3
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40
3
7
48
1.50
23942520--23942597
36
2.2
36
100
0
156
24
29
15
30
1.95
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3
14.3
3
85
0
59
0
39
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58
1.11
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2.4
29
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37
8
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1.72
23964459--23964502
21
2.1
21
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0
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4
4
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1.36
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2.6
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13
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44
1
1
53
1.15
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2.4
24
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2
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33
0
0
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0.92
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2.2
57
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0
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42
25
13
18
1.86
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26
2.9
26
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2
116
53
8
6
32
1.56
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46
1.9
44
90
4
136
32
13
24
29
1.94
23974992--23975116
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2.8
45
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4
135
34
14
23
28
1.94
24006661--24006768
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2.4
44
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29
23
13
33
1.93
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22
2.0
22
100
0
88
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9
0
31
1.29
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19
1.9
19
89
10
58
43
2
0
54
1.14
24015481--24015510
9
3.3
9
100
0
60
50
0
10
40
1.36
24015472--24015552
38
2.2
37
81
12
96
59
1
3
35
1.23
24015471--24015556
18
4.7
18
72
15
68
59
1
3
36
1.22
24015610--24015658
11
4.7
11
75
12
50
65
2
2
30
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24015926--24015962
17
2.2
17
90
4
58
72
5
0
21
1.04
24016077--24016105
14
2.0
15
93
6
51
20
0
3
75
0.94
24016167--24016207
22
1.9
21
85
5
55
41
0
4
53
1.22
24016274--24016299
12
2.2
12
100
0
52
23
0
0
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0.78
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29
2.3
29
82
7
73
46
5
19
28
1.73
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10
2.8
10
100
0
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0
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46
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1.88
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92
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0
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2.0
17
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48
0
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1.45
24027883--24027946
32
2.0
32
96
0
119
31
26
18
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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