Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  200  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59828652--59828712
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12
0.95
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3.0
30
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15
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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320
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21
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2.1
19
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35
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22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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28
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1.88
59905721--59905818
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3.3
30
72
4
90
27
26
16
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59907793--59907843
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12
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0
85
0.68
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2.3
20
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0
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58
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0
25
10
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10
4.5
10
81
5
56
15
23
21
39
1.92
59911983--59912031
21
2.4
20
89
3
71
14
22
22
40
1.90
59915119--59915220
10
9.1
10
75
19
60
61
6
8
22
1.49
59915104--59915206
24
4.3
25
80
15
119
62
5
9
22
1.48
59915118--59915216
12
8.5
12
78
5
89
63
6
9
21
1.45
59915179--59915220
20
2.0
20
95
4
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69
9
2
19
1.28
59916530--59916702
46
3.7
46
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10
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23
19
27
30
1.98
59916527--59916697
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1.8
93
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0
288
22
19
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29
1.98
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28
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1.94
59921940--59921974
10
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10
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1.95
59921935--59921974
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1.92
59921934--59921986
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2.5
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3
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37
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1.89
59922020--59922086
25
2.7
25
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0
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28
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1.99
59922310--59922393
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31
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1
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17
26
23
1.97
59924171--59924237
30
2.2
30
89
5
100
26
13
29
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59924184--59924249
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2.2
30
81
10
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25
13
34
25
1.93
59926073--59926155
30
2.7
30
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9
80
13
20
1
65
1.34
59926131--59926155
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2.1
12
100
0
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8
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0
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1.02
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12
100
0
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25
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21
3.2
21
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2
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2
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1.08
59926234--59926302
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16
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2
20
2
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1.09
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19
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4
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0
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1.94
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1.90
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2.0
35
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2.0
28
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1.58
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19
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6
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0
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22
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15
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4
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30
2.3
30
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47
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1.72
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29
2.1
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35
0
3
60
1.12
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8
3.1
8
100
0
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24
0
0
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0.80
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3.3
33
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20
1.98
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3.7
45
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2
140
37
16
24
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59951082--59951382
46
6.6
46
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1
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40
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20
1.90
59951179--59951382
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2.2
92
87
0
282
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20
1.89
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27
2.2
27
84
0
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1.88
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2.4
27
92
0
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1.86
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2.1
80
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27
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2.2
107
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12
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1.75
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10
5.9
10
77
11
61
36
11
19
32
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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