Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  46  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16634509--16634562
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2.3
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23
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21
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2
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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16702965--16703226
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0
100
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15
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2.0
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42
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2.0
225
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50
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1.98
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1.8
93
91
1
279
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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144
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13
33
1.93
16784117--16784224
44
2.4
44
87
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144
29
23
13
33
1.93
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125
3.0
124
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0
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2.0
33
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0
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12
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14
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1.87
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14
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100
0
104
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25
15
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16866914--16866954
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29
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0
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1.99
16878637--16878672
5
7.0
5
87
6
54
58
0
0
41
0.98
16878635--16878699
20
3.4
19
74
19
55
53
1
0
44
1.09
16890982--16891031
2
25.0
2
95
0
91
52
0
48
0
1.00
16891598--16891639
21
2.0
22
85
4
59
69
11
16
2
1.29
16894527--16894564
8
4.6
9
81
18
55
44
0
0
55
0.99
16894527--16894556
15
1.9
16
93
6
53
43
0
0
56
0.99
16894673--16894702
16
1.9
15
93
6
51
40
6
3
50
1.45
16900662--16900775
56
2.0
56
93
0
192
22
24
11
41
1.87
16903775--16904058
149
1.9
146
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2
370
37
8
8
46
1.64
16904203--16904259
28
2.0
29
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50
0
3
45
1.18
16904624--16904662
3
13.7
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2
0
28
1.02
16904624--16904662
17
2.3
17
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0
60
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2
0
28
1.02
16904624--16904662
11
3.4
12
86
10
55
69
2
0
28
1.02
16904623--16904662
14
2.9
14
92
0
62
70
2
0
27
1.01
16927666--16927701
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16933276--16933316
3
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3
100
0
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0
0
68
0.90
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3
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3
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0
112
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33
0
32
1.58
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2
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2
100
0
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48
0
51
0
1.00
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3
19.0
3
100
0
114
33
0
0
66
0.92
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2.0
49
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0
187
48
3
16
31
1.61
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19
1.9
19
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0
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59
2
0
37
1.12
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19
4.6
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10
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58
1
2
37
1.18
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2.2
28
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1.33
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2.0
33
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4
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26
1.74
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24
2.5
24
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5
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15
13
37
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1.86
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2.0
23
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0
0
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2.0
40
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0
108
24
2
9
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1.38
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2.6
13
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0
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64
0
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1.17
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2
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2
100
0
50
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0
0
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1.00
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1
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1.40
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15
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15
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1.23
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21
2.0
21
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0
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4
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2
1.32
16993780--16993839
30
2.0
30
96
0
111
20
23
15
41
1.89
16994113--16994142
15
2.0
15
100
0
60
60
20
0
20
1.37
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1
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1
100
0
52
100
0
0
0
0.00
16999098--16999132
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1.9
17
88
11
52
65
11
2
20
1.37
17002216--17002279
13
4.9
13
80
0
83
35
23
7
32
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17002216--17002287
26
2.8
26
78
2
83
36
22
8
33
1.84
17002219--17002287
13
5.4
13
80
1
59
37
23
8
30
1.85
17016009--17016062
27
2.0
27
100
0
108
14
14
14
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1.70
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10
11.1
10
68
11
53
28
4
0
65
1.19
17020911--17020952
19
2.3
19
88
8
61
33
4
2
59
1.31
17020948--17020996
20
2.4
21
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55
22
4
0
73
1.00
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245
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18
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1.78
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27
2.2
30
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13
80
60
0
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36
1.13
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18
2.1
18
95
0
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31
10
7
50
1.66
17029515--17029554
18
2.2
18
86
0
53
32
12
10
45
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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