Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  305  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90627668--90627741
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0
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2.5
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4.1
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63
0
10
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1.27
90633959--90634110
49
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167
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1
10
26
1.39
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2.1
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2.0
24
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362
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18
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2.1
19
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10
0
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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3.2
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22
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2
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21
2.8
20
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73
32
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1.42
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19
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2
2
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2
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54
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2.0
19
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2
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36
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5
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16
74
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59
64
0
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24
1.27
90641567--90641618
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1.28
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27
14
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2.4
19
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58
23
15
0
60
1.34
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13
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1.34
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26
68
21
101
24
10
0
63
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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5
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13
0
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1.35
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10
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3.3
44
92
0
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37
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10
50
1.48
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12
2.6
12
94
0
53
70
6
0
22
1.09
90650965--90651029
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2.1
30
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76
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4
3
26
1.26
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2.0
55
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172
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16
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9
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1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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0
10
22
1.21
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1
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1.36
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0
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11
1
63
1.37
90677741--90677835
6
17.3
6
77
13
55
20
20
0
60
1.37
90677741--90677835
11
8.7
11
78
5
86
20
20
0
60
1.37
90677735--90677835
16
6.2
16
71
13
62
19
18
0
61
1.35
90677828--90677872
23
2.1
22
88
12
67
28
4
0
66
1.11
90677828--90677935
22
5.0
22
70
15
73
28
8
0
62
1.24
90677825--90678025
49
4.4
46
74
14
159
27
9
1
61
1.37
90677995--90678204
76
2.7
75
82
6
244
28
14
2
55
1.52
90678036--90678157
28
4.7
25
71
19
99
26
13
0
59
1.41
90678034--90678204
76
2.2
76
88
5
247
27
15
1
54
1.51
90678034--90678233
76
2.6
76
82
7
185
27
17
2
53
1.54
90681219--90681467
105
2.4
105
83
6
303
29
21
16
32
1.95
90690772--90690821
18
2.8
17
80
14
57
28
4
0
68
1.08
90690790--90690885
16
6.3
15
74
23
69
32
4
2
61
1.27
90690771--90690894
12
10.5
12
68
19
82
31
4
1
62
1.23
90694526--90694628
38
2.7
38
90
0
152
22
23
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90694626--90694952
43
7.6
43
96
0
600
10
25
33
30
1.89
90704353--90704488
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
33
1.78
90720297--90720401
53
2.0
53
98
1
203
34
9
5
50
1.59
90727493--90727664
75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90
90727498--90727664
35
4.6
35
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192
33
23
10
31
1.89
90734993--90735160
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
90734988--90735160
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
90737688--90737759
36
2.0
36
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0
126
26
15
9
48
1.75
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183
2.0
183
96
0
678
31
14
25
28
1.95
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34
2.2
33
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7
92
31
20
23
23
1.98
90748736--90748792
25
2.3
25
87
0
87
40
15
12
31
1.85
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3.0
42
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2
155
29
24
14
31
1.94
90751688--90751864
31
5.7
31
91
1
257
25
25
20
28
1.99
90751881--90752024
56
2.7
55
90
6
226
29
22
15
33
1.94
90751912--90752024
50
2.3
50
86
7
160
28
23
13
35
1.92
90762048--90762375
173
1.9
171
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4
457
33
12
20
33
1.90
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3
15.3
3
100
0
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67
0
0
32
0.91
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3.8
46
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17
162
30
28
15
25
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21
4.0
22
80
10
97
36
26
22
15
1.93
90783720--90783802
28
3.0
28
89
3
123
46
30
3
19
1.66
90783706--90783776
28
2.9
23
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18
79
45
33
4
16
1.67
90786840--90787059
110
2.0
110
97
0
413
27
17
11
44
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90791197--90791227
12
2.6
12
89
0
53
22
9
35
32
1.87
90791159--90791263
54
1.9
54
90
0
165
28
13
36
21
1.91
90791211--90791317
42
2.5
42
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3
108
27
10
41
21
1.85
90791260--90791426
84
2.0
84
85
2
228
29
11
38
20
1.88
90791432--90791538
42
2.5
42
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171
29
10
34
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1.89
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6
8.2
6
100
0
98
18
0
0
81
0.69
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27
2.7
27
89
4
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28
24
13
33
1.93
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27
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104
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24
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1.87
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17
2.1
17
94
0
63
33
27
11
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1.91
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26
2.1
26
100
0
108
37
11
18
33
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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