Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  16  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5828612--5828762
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26
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5
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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4
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0.97
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2
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0
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1.00
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1
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105
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6006616--6006779
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0
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2
0
39
1.11
6061849--6061889
6
6.5
6
83
10
55
17
0
4
78
0.93
6067916--6067964
18
2.7
18
75
12
55
46
4
2
46
1.33
6069853--6069887
10
3.5
10
92
7
54
17
8
0
74
1.06
6083120--6083206
4
21.2
4
79
9
86
66
4
25
3
1.26
6083104--6083200
50
1.9
50
97
0
185
61
7
26
4
1.40
6092867--6092893
5
5.4
5
100
0
54
40
18
22
18
1.91
6099506--6099555
13
3.9
13
81
5
57
78
0
12
10
0.98
6099520--6099554
6
5.7
6
96
3
61
85
0
14
0
0.59
6105476--6105507
16
2.0
16
93
0
55
46
12
12
28
1.78
6110027--6110150
64
1.9
64
91
0
203
29
8
28
33
1.86
6112208--6112255
24
2.0
23
88
4
69
12
16
8
62
1.53
6116561--6116621
30
2.0
30
100
0
122
40
13
19
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6118161--6118205
18
2.4
19
81
7
56
4
24
0
71
1.05
6118992--6119017
10
2.6
10
100
0
52
50
7
0
42
1.31
6126393--6126426
17
2.0
17
100
0
68
11
23
17
47
1.81
6146704--6146729
9
2.9
9
100
0
52
30
11
11
46
1.76
6150462--6150533
35
2.1
35
89
5
110
40
19
1
38
1.60
6153926--6153959
16
2.1
16
88
0
50
23
2
2
70
1.15
6158290--6158377
39
2.3
39
91
0
140
40
20
22
15
1.90
6158296--6158360
21
3.2
21
63
12
55
43
18
23
15
1.88
6159479--6159516
18
2.1
18
100
0
76
15
34
15
34
1.90
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5
10.0
5
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11
61
41
0
1
56
1.10
6162116--6162172
8
6.6
9
74
22
59
43
0
1
54
1.10
6162117--6162172
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
6163443--6163469
11
2.5
11
100
0
54
33
0
11
55
1.35
6163495--6163533
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
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35
3.7
35
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0
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21
9
34
1.86
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2
18.0
2
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0
63
52
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0
0
1.00
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44
2.0
44
100
0
176
29
29
4
36
1.77
6178762--6178788
12
2.2
12
100
0
54
92
7
0
0
0.38
6178848--6178904
18
3.1
18
87
2
78
57
1
3
36
1.26
6187968--6188033
31
2.1
30
100
0
114
39
13
25
21
1.90
6192758--6192829
27
2.9
22
74
23
63
27
1
1
69
1.05
6192777--6192852
27
2.6
27
80
17
66
30
1
0
68
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6192941--6192994
16
3.4
16
85
10
67
62
0
0
37
0.95
6193800--6193903
25
4.1
24
67
15
59
48
0
2
49
1.16
6193799--6193841
21
2.0
23
86
13
65
48
0
0
51
1.00
6193944--6194010
35
1.9
35
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0
116
40
2
11
44
1.56
6194232--6194272
21
2.0
21
95
0
73
24
17
29
29
1.97
6195883--6196056
46
3.8
45
80
10
199
20
20
30
28
1.98
6195878--6196049
93
1.8
93
93
0
299
20
20
30
27
1.98
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5.7
45
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6
322
21
23
15
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1.92
6197001--6197075
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0
150
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6199222--6199273
11
4.7
11
73
17
54
65
3
0
30
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335