Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  313  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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14
11
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92560011--92560084
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18
1.43
92574500--92574539
11
3.6
11
80
12
55
65
2
15
17
1.39
92578989--92579031
18
2.5
17
88
7
68
16
25
41
16
1.88
92582845--92582911
29
2.2
30
78
5
73
46
2
5
44
1.43
92583401--92583441
22
1.9
22
90
5
66
58
0
0
41
0.98
92593342--92593472
3
44.0
3
81
7
144
64
0
5
29
1.15
92595362--92595430
30
2.3
30
80
7
77
46
2
1
49
1.25
92595656--92595700
21
2.1
21
84
8
56
53
0
2
44
1.13
92596605--92596647
21
2.2
19
83
8
50
51
0
0
48
1.00
92596786--92596812
8
3.4
8
100
0
54
62
0
22
14
1.31
92599407--92599443
9
4.1
9
92
0
65
29
10
13
45
1.77
92599866--92599953
43
2.0
43
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4
124
37
4
6
51
1.49
92599890--92599972
43
2.0
43
81
9
100
40
4
6
48
1.49
92601656--92601696
13
3.1
14
82
10
50
48
14
17
19
1.81
92613819--92613943
63
2.0
62
93
4
216
28
10
24
37
1.88
92615916--92615959
21
2.1
21
95
0
79
18
0
15
65
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
14
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0
54
29
0
0
70
0.88
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2.0
36
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0
110
49
10
8
31
1.67
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20
2.0
20
100
0
80
25
25
15
35
1.94
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21
2.0
21
100
0
84
28
28
4
38
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18
4.9
18
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5
108
32
23
13
30
1.93
92644264--92644354
36
2.5
37
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5
132
31
23
14
30
1.94
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2.2
26
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60
5
0
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1.19
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2
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100
0
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0
0
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1.00
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4
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2.3
21
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12
2
52
33
1.51
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136
2.1
136
98
0
552
24
18
25
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1.98
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26
3.2
25
93
5
139
34
4
24
36
1.77
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21
2.3
21
85
7
62
12
2
52
33
1.51
92666926--92666998
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7.7
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71
20
51
60
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1
34
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92666921--92667176
14
18.1
14
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20
110
58
1
5
33
1.31
92666960--92667221
16
16.4
16
68
20
88
59
1
6
32
1.32
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78
16
107
60
1
7
30
1.30
92677575--92677628
26
2.1
26
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59
5
0
35
1.21
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2
12.5
2
100
0
50
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0
0
48
1.00
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2.1
22
100
0
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21
12
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92680427--92680461
2
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2
100
0
70
51
0
0
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158
2.2
152
84
10
451
35
12
11
40
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92686154--92686200
24
2.0
24
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8
69
40
6
6
46
1.55
92686295--92686349
26
2.1
25
83
6
65
21
16
21
40
1.91
92686424--92686461
2
19.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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6
2
46
1.39
92686694--92686726
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2.8
12
100
0
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66
0
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0
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3
0
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0
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0
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32
14
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31
1.93
92702148--92702240
36
2.6
37
81
6
111
33
13
21
31
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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