Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  18  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6688230--6688288
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0
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0
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1
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26
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0
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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9
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18
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0
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5
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19
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0
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19
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2.0
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5
1
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19
4.3
18
69
20
53
35
2
1
60
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
1
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1.28
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1.9
53
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2.0
21
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0
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2.0
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0
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17
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2.2
24
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19
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38
4
0
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1.20
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18
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20
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0
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212
23
19
10
46
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6917831--6917951
28
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2.8
14
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51
27
25
0
47
1.52
6934668--6934708
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
6936216--6936254
19
2.1
19
95
0
69
33
5
10
51
1.58
6936219--6936262
19
2.4
19
78
17
56
34
6
9
50
1.61
6936547--6936580
2
17.0
2
93
0
59
47
0
0
52
1.00
6939556--6939598
18
2.4
18
88
0
59
46
6
27
18
1.75
6939664--6939753
30
3.0
29
87
6
117
8
16
41
33
1.80
6939674--6939749
15
5.2
13
71
22
62
9
15
42
32
1.79
6941460--6941485
13
2.0
13
100
0
52
76
0
23
0
0.78
6943536--6943592
21
2.8
21
89
5
82
56
5
7
31
1.49
6944604--6944661
30
1.9
30
82
6
73
36
1
8
53
1.42
6946086--6946130
15
3.0
14
81
15
54
53
0
2
44
1.13
6947489--6947514
12
2.2
12
100
0
52
23
34
7
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6953018--6953050
2
16.5
2
93
0
57
48
0
0
51
1.00
6964893--6965035
72
2.0
72
100
0
286
25
11
28
34
1.90
6966905--6966936
2
16.0
2
100
0
64
50
0
50
0
1.00
6971301--6971332
15
2.0
17
88
11
50
68
0
6
25
1.12
6971881--6971934
15
3.7
15
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16
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66
3
1
27
1.19
6977757--6977796
16
2.6
15
84
7
53
67
0
0
32
0.91
6984677--6984701
13
1.9
13
100
0
50
40
0
8
52
1.31
6987311--6987364
21
2.6
21
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35
12
0
51
1.40
6989911--6989935
3
8.3
3
100
0
50
32
0
32
36
1.58
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2.3
11
100
0
50
60
0
0
40
0.97
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25
2.1
25
96
0
95
46
11
11
30
1.76
7015765--7015854
33
2.5
38
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20
93
53
3
1
42
1.24
7015791--7015842
18
3.1
18
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10
56
55
1
0
42
1.10
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33
2.0
33
100
0
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27
15
12
45
1.81
7035376--7035551
46
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46
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12
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21
19
28
30
1.98
7035373--7035543
93
1.8
93
89
0
270
21
20
28
29
1.98
7046084--7046131
25
1.9
25
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8
71
37
22
8
31
1.84
7046387--7046434
24
2.0
24
91
0
78
14
18
10
56
1.66
7047638--7047684
22
2.1
22
100
0
94
27
23
14
34
1.94
7066310--7066348
2
19.5
2
100
0
78
48
0
0
51
1.00
7067660--7067702
11
3.8
11
80
17
52
65
2
2
30
1.18
7100900--7100969
30
2.3
29
83
11
79
7
14
5
72
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7102110--7102176
27
2.4
28
92
5
109
62
1
0
35
1.04
7102518--7102553
17
2.1
17
89
0
54
2
27
2
66
1.19
7102791--7102829
12
3.2
12
81
0
51
28
7
38
25
1.83
7104529--7104755
46
4.9
47
91
2
311
21
23
14
40
1.90
7106823--7106870
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
7108084--7108128
19
2.4
18
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13
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0
33
0
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0.92
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2.0
20
100
0
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2.0
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0
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15
0
0
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0.63
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14
2.1
14
100
0
58
13
0
0
86
0.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335