Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  279  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0.58
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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0
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24
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75
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137
64
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3
26
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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6
162
25
31
15
26
1.96
84586236--84586366
40
3.3
39
78
9
115
23
27
22
25
2.00
84588473--84588506
17
2.0
17
88
11
52
32
0
5
61
1.20
84590576--84590732
39
4.0
40
85
2
160
28
28
23
19
1.98
84590608--84590732
39
3.2
39
87
2
171
28
27
24
20
1.99
84593423--84593452
13
2.2
14
94
5
53
23
3
36
36
1.71
84593493--84593576
28
3.0
27
86
8
105
19
4
30
45
1.71
84593520--84593614
23
3.9
22
72
20
66
16
5
32
45
1.70
84599519--84599564
21
2.2
20
84
3
56
0
28
6
65
1.17
84599574--84599616
19
2.3
19
84
11
61
11
11
0
76
1.02
84599615--84599652
8
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39
2
0
57
1.12
84604081--84604448
49
7.8
49
73
13
211
25
29
18
26
1.98
84604278--84604445
46
3.6
45
73
10
140
24
29
19
27
1.98
84604277--84604448
95
1.8
93
86
2
245
25
29
19
26
1.98
84611686--84611728
19
2.2
20
87
4
61
34
11
18
34
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84611775--84611870
25
3.9
24
82
10
104
28
22
22
26
1.99
84619581--84619634
11
5.4
10
78
12
58
35
11
18
35
1.86
84619681--84619800
25
4.9
24
82
7
134
27
23
23
25
2.00
84619681--84619800
49
2.4
50
80
10
140
27
23
23
25
2.00
84619743--84619827
24
3.5
24
85
6
91
28
21
23
27
1.99
84620021--84620105
32
2.7
31
87
3
127
34
15
25
24
1.95
84624259--84624513
126
2.0
126
90
0
402
39
18
17
24
1.92
84633910--84634125
39
5.5
40
91
4
325
25
28
23
23
2.00
84633910--84634122
118
1.8
118
87
6
324
25
28
23
23
2.00
84642117--84642334
40
5.5
40
92
2
343
24
28
23
23
2.00
84650324--84650540
40
5.5
40
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2
359
24
28
23
23
2.00
84650324--84650544
79
2.8
78
92
3
354
24
27
23
24
2.00
84657582--84657799
40
5.5
40
92
2
334
24
28
23
22
1.99
84663324--84663458
60
2.2
59
82
8
148
27
26
19
26
1.99
84663451--84663506
19
2.9
19
81
2
58
32
23
17
26
1.97
84663533--84663598
33
2.0
33
100
0
132
15
54
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24
1.63
84663561--84663606
22
2.1
22
84
4
58
15
54
4
26
1.59
84671402--84671609
40
5.2
40
82
2
202
25
23
25
25
2.00
84671404--84671609
80
2.6
80
83
3
236
25
23
26
24
2.00
84677918--84678014
27
3.6
27
82
0
104
31
17
20
29
1.96
84681483--84681797
140
2.2
140
79
12
324
21
31
19
27
1.97
84683288--84683323
16
2.3
16
95
4
65
36
5
13
44
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84693281--84693433
40
3.8
40
80
0
137
24
28
22
24
1.99
84693289--84693471
40
4.6
40
78
3
136
22
26
22
27
1.99
84699490--84699674
100
1.9
100
91
0
307
41
9
20
29
1.83
84700234--84700271
15
2.4
16
86
4
51
52
0
2
44
1.14
84705808--84705975
40
4.2
40
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1
158
22
27
23
26
2.00
84705824--84705973
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1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
84715614--84715741
40
3.2
40
80
0
130
24
27
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1.99
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23
100
0
100
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1.56
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6
4.5
6
100
0
54
14
0
0
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0.61
84732507--84732795
50
5.7
50
81
7
318
31
25
17
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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