Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr05 97880472 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97880472

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   

This is table  21  of  335  ( 40112 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7847825--7847853
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2.0
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17
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50
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13
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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182
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3.0
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2.2
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18
29
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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30
1.97
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4.8
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14
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1.94
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2.4
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29
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29
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11
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10
78
15
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60
1
0
37
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8068193--8068245
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3.3
16
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1
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1.08
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167
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3
0
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1.16
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0
0
50
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1
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1.26
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25
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78
80
3
7
8
1.01
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15
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1
571
18
25
21
34
1.96
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173
2.0
173
93
0
607
18
25
21
34
1.96
8098565--8098606
19
2.2
20
86
4
59
47
7
19
26
1.74
8100562--8100650
3
29.7
3
74
8
65
60
5
5
28
1.42
8105780--8105894
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
8105780--8105913
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
8111926--8111982
25
2.2
25
84
9
71
80
3
7
8
1.00
8116468--8116498
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
8119449--8119479
5
6.2
5
100
0
62
0
58
0
41
0.98
8119551--8119603
27
2.0
27
100
0
106
9
22
3
64
1.40
8140316--8140375
30
2.0
30
83
9
77
50
5
13
31
1.63
8141222--8141255
16
2.1
16
94
0
59
47
0
8
44
1.34
8168400--8168509
51
2.2
51
94
0
193
28
23
15
32
1.95
8170131--8170182
21
2.5
21
73
17
54
42
13
5
38
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8171643--8171676
16
2.1
16
88
0
50
47
2
0
50
1.16
8171707--8171752
23
2.0
23
86
0
65
36
8
10
43
1.71
8181983--8182147
53
3.1
53
86
6
210
26
16
27
29
1.97
8183926--8183959
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
8195311--8195345
17
2.1
18
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10
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51
0
0
48
1.00
8203363--8203440
17
4.6
16
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21
52
41
0
1
57
1.07
8203350--8203394
21
2.1
21
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0
72
40
0
0
60
0.97
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10
3.3
10
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4
50
52
0
2
44
1.16
8217288--8217348
31
2.0
31
96
0
113
50
6
40
1
1.38
8217331--8217368
15
2.4
16
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8
60
65
0
34
0
0.93
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2
15.5
2
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0
62
51
0
0
48
1.00
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16
2.1
16
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10
52
55
0
8
35
1.31
8218650--8218717
18
3.7
18
80
2
73
30
7
14
47
1.72
8223134--8223176
22
1.9
23
90
4
70
53
0
6
39
1.28
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34
2.0
34
100
0
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23
24
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34
1.96
8232430--8232468
17
2.2
18
86
9
53
46
10
5
38
1.60
8240918--8241049
27
4.9
27
89
0
192
36
18
18
27
1.94
8248464--8248614
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
8256529--8256585
16
3.6
16
80
13
55
57
5
5
31
1.43
8258219--8258262
12
3.7
12
87
0
70
34
0
2
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1.07
8258215--8258265
24
2.1
24
100
0
102
33
0
3
62
1.13
8258383--8258453
29
2.4
30
81
6
74
59
8
8
23
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8266774--8266816
19
2.3
19
80
4
52
39
2
0
58
1.11
8273659--8273701
11
3.8
11
87
6
59
53
2
44
0
1.13
8273664--8273699
6
6.2
6
93
6
56
52
0
47
0
1.00
8276401--8276447
20
2.2
22
78
17
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42
2
2
53
1.25
8277341--8277379
15
2.5
15
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4
51
33
0
0
66
0.92
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29
3.8
29
69
18
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43
0
0
55
1.06
8277377--8277437
30
2.0
30
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42
0
1
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8295239--8295271
2
16.0
2
93
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48
0
48
3
1.17
8300730--8300774
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2.0
23
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2
2
37
1.23
8300727--8300777
15
3.2
16
79
20
63
58
1
5
33
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335