Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  114  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38477346--38477470
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41
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0
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22
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2.1
27
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1.81
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31
1.96
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1.9
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2.4
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2.1
309
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2.3
131
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0
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27
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16
156
28
26
16
28
1.97
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537
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24
16
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1.97
38491107--38491588
88
5.5
88
76
8
376
26
23
17
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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0
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23
17
31
1.97
38491458--38491739
132
2.1
132
85
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417
25
23
17
33
1.96
38491239--38491720
220
2.2
219
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1
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26
23
17
31
1.97
38492614--38492684
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8.6
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21
0
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1
18
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17
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22
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20
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11
20
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3.8
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12
189
20
19
30
30
1.97
38502521--38502692
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1.8
93
91
0
281
20
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25
5.2
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1
3
31
1.21
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6.8
12
73
20
59
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1
5
31
1.27
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2.2
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5
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21
2
4
72
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0
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2.0
29
84
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77
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13
6
59
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.9
25
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23
26
27
1.99
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21
2.9
21
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63
32
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13
37
1.87
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40
4.4
40
94
0
314
29
29
19
22
1.98
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2.0
41
82
9
101
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18
42
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1.89
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4.8
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207
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1.95
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108
1.8
110
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300
34
18
24
21
1.96
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9
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20
29
29
1.98
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10
18
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1.64
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3.0
30
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1.97
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19
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1.97
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20
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5
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2.5
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1.12
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1.49
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2.0
62
90
0
196
33
15
19
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38564791--38564830
21
1.9
21
94
0
71
32
25
12
30
1.92
38566355--38566379
11
2.3
11
100
0
50
16
36
8
40
1.77
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2.7
25
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33
21
18
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1.96
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13
210
21
21
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96
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21
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3.7
15
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87
12
16
10
60
1.58
38592298--38592465
46
3.7
46
76
15
193
22
20
27
29
1.98
38592291--38592460
92
1.8
93
93
1
297
22
21
28
28
1.99
38600320--38600384
32
2.0
32
90
0
103
52
9
13
24
1.70
38601924--38601977
28
1.9
28
96
0
99
44
5
20
29
1.74
38602260--38602292
16
2.2
15
89
10
50
48
6
15
30
1.69
38605049--38605104
16
3.4
16
74
16
51
35
0
5
58
1.21
38607107--38607223
56
2.1
56
100
0
234
20
31
3
44
1.68
38609091--38609257
54
3.1
54
81
9
189
40
19
7
31
1.80
38609112--38609275
27
6.1
26
76
13
127
37
20
7
34
1.82
38609237--38609339
27
3.8
26
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143
32
22
7
37
1.83
38609091--38609376
27
10.6
27
77
10
126
37
20
8
33
1.82
38609224--38609349
54
2.3
54
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2
155
36
21
7
34
1.81
38609334--38609689
27
13.2
27
87
2
439
36
19
17
26
1.94
38609910--38609992
27
3.1
26
87
5
112
19
21
21
37
1.94
38610303--38610376
27
2.8
27
85
6
89
17
24
21
36
1.95
38610494--38610671
6
28.8
6
72
17
116
19
18
13
48
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38610522--38610676
19
7.9
19
73
19
115
19
18
14
48
1.81
38610500--38610561
25
2.5
25
91
0
97
17
19
16
46
1.84
38610495--38610660
62
2.7
62
91
0
260
19
18
13
48
1.81
38610522--38610598
37
2.1
37
90
0
118
18
19
15
46
1.84
38610557--38610623
25
2.7
25
85
0
89
20
19
11
47
1.81
38610578--38610676
37
2.6
37
78
7
110
21
17
13
48
1.80
38622191--38622313
56
2.2
56
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4
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30
12
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1.91
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13
2.1
13
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0
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0
0
0.61
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3.8
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185
22
19
27
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1.98
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93
1.8
93
88
0
263
22
19
26
30
1.98
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19
2.1
19
100
0
78
41
15
10
33
1.81
38667153--38667284
54
2.4
54
97
0
255
26
18
25
30
1.98
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8
5.5
8
80
0
52
47
20
20
11
1.80
38686057--38686107
24
2.1
24
85
0
66
49
19
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9
1.77
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29
2.6
28
79
4
87
29
16
25
29
1.96
38686316--38686399
28
3.0
28
80
3
96
28
15
26
29
1.96
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31
7.7
31
88
6
354
28
24
16
30
1.96
38690611--38690663
25
2.1
25
92
0
88
26
26
13
33
1.93
38690502--38690721
87
2.5
88
89
5
327
29
25
15
30
1.96
38690518--38690734
118
1.8
118
93
0
380
28
24
15
30
1.96
38690758--38690849
42
2.2
42
94
0
157
34
20
13
31
1.91
38690997--38691066
25
2.8
25
89
4
97
22
25
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38691880--38691942
27
2.3
27
81
5
74
22
25
17
34
1.95
38691973--38692103
27
4.8
27
79
10
113
32
8
17
41
1.79
38691973--38692129
56
2.9
54
78
5
154
31
8
18
41
1.80
38691976--38692181
27
7.6
26
74
11
94
30
7
19
42
1.79
38692045--38692181
27
5.1
27
77
8
118
28
5
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44
1.75
38692060--38692210
80
1.9
81
83
4
198
26
8
20
44
1.80
38692215--38692304
27
3.3
27
84
3
119
40
11
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2.0
22
95
0
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16
3.5
16
82
2
58
45
25
18
10
1.82
38697585--38697699
29
4.0
29
84
2
135
26
15
29
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343