Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  289  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95566764--95566796
14
2.4
14
90
5
50
33
0
3
63
1.10
95566739--95566783
19
2.3
21
81
14
60
28
2
2
66
1.15
95566845--95566898
28
1.9
28
85
7
74
33
1
7
57
1.37
95567800--95567942
33
4.3
33
76
7
121
27
4
45
22
1.71
95568046--95568203
51
3.1
51
89
0
235
28
8
26
36
1.86
95571661--95571892
49
4.7
49
82
3
284
28
27
19
25
1.99
95571661--95571892
100
2.3
98
84
2
293
28
27
19
25
1.99
95572137--95572189
26
2.0
27
85
3
72
39
13
7
39
1.73
95575805--95575846
19
2.2
20
86
4
59
40
11
14
33
1.82
95576477--95576521
22
2.0
22
95
0
81
40
11
11
37
1.76
95578988--95579379
88
4.6
87
77
7
232
33
12
11
42
1.79
95579155--95579313
85
1.9
85
85
2
221
30
10
12
45
1.76
95579434--95579669
74
3.1
73
82
9
267
45
11
9
33
1.74
95580024--95580070
22
2.1
22
88
7
69
59
2
0
38
1.09
95580033--95580086
16
3.2
16
76
5
54
59
1
1
37
1.19
95580030--95580092
32
1.9
34
87
6
94
60
1
1
36
1.16
95582682--95582767
37
2.3
37
95
0
154
40
9
8
41
1.67
95584448--95584498
25
2.1
25
82
10
61
39
17
25
17
1.92
95586692--95586737
22
2.0
23
87
4
67
30
6
30
32
1.83
95586699--95586748
23
2.2
22
85
3
64
30
4
30
36
1.76
95599662--95600442
205
3.8
203
91
2
1190
30
17
22
30
1.96
95600510--95601014
44
11.5
44
76
9
403
30
17
25
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95600540--95601014
133
3.6
132
91
2
742
30
17
25
26
1.97
95602084--95602125
22
1.9
22
85
0
57
47
2
7
42
1.43
95602143--95602296
39
3.9
40
94
3
251
47
3
19
29
1.65
95602143--95602296
79
1.9
79
90
5
249
47
3
19
29
1.65
95610302--95610329
6
4.7
6
100
0
56
50
0
50
0
1.00
95610277--95610329
18
2.9
18
82
0
52
62
0
37
0
0.96
95611365--95611420
23
2.7
20
75
13
51
44
3
0
51
1.18
95611710--95611743
13
2.7
13
90
4
52
85
0
14
0
0.60
95613862--95613916
28
1.9
29
81
3
67
54
3
0
41
1.18
95617242--95617298
9
6.2
9
74
9
53
35
3
0
61
1.13
95617280--95617320
22
2.0
22
85
9
59
41
0
2
56
1.13
95617239--95617330
29
3.2
28
80
9
96
41
2
1
55
1.19
95617288--95617337
15
3.4
15
71
13
50
44
0
2
54
1.11
95619175--95619208
15
2.4
14
85
9
50
61
2
5
29
1.34
95619458--95619509
21
2.5
21
81
3
61
28
1
1
67
1.12
95620675--95620708
8
4.2
8
100
0
68
88
0
11
0
0.52
95625573--95625621
24
2.0
24
100
0
98
32
42
8
16
1.77
95631986--95632026
6
6.7
6
94
5
73
85
0
0
14
0.60
95632515--95632555
20
2.0
21
81
13
59
29
0
0
70
0.87
95632910--95632945
12
3.1
12
92
8
65
44
0
0
55
0.99
95632910--95632941
11
2.8
11
95
4
55
40
0
0
59
0.97
95633746--95633770
6
4.2
6
100
0
50
80
0
0
20
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95634956--95634990
16
2.1
17
89
5
54
25
2
2
68
1.17
95636299--95636331
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
95637765--95637820
20
2.8
20
86
8
69
44
35
1
17
1.60
95637842--95637972
28
4.7
27
70
18
63
23
3
27
45
1.67
95640190--95640243
21
2.5
22
80
19
62
68
1
1
27
1.10
95640597--95640636
21
1.9
21
90
10
64
22
12
10
55
1.67
95640937--95641043
19
5.1
19
67
26
65
38
0
1
58
1.15
95641012--95641071
20
3.1
19
83
9
59
45
1
3
50
1.28
95642278--95642347
26
2.7
26
80
2
88
15
27
24
32
1.95
95649892--95649976
25
3.3
25
72
9
73
21
28
21
29
1.98
95653346--95653389
21
2.1
21
86
0
61
52
18
4
25
1.64
95653774--95653799
10
2.6
10
100
0
52
80
0
19
0
0.71
95656712--95656812
23
4.4
23
77
3
87
22
20
18
37
1.94
95656987--95657071
20
4.3
19
81
10
89
29
10
21
38
1.87
95657035--95657079
20
2.2
20
88
0
63
35
11
20
33
1.88
95656987--95657090
40
2.6
38
79
13
111
30
8
20
40
1.82
95668671--95668807
68
2.0
68
95
0
247
43
18
4
34
1.70
95668954--95669000
3
15.7
3
100
0
94
31
0
0
68
0.90
95674115--95674440
131
2.5
131
83
3
406
39
13
15
31
1.86
95676897--95677011
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
95676897--95677011
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
95678628--95678789
26
6.2
26
94
0
261
35
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95678631--95678785
78
2.0
78
97
0
292
35
25
5
33
1.80
95680683--95680707
12
2.1
12
100
0
50
20
0
32
48
1.50
95681106--95681161
26
2.2
26
83
6
69
25
8
0
66
1.21
95681232--95681279
26
1.9
26
91
8
82
31
0
4
64
1.12
95682001--95682149
67
2.2
67
86
3
201
30
12
17
39
1.87
95696227--95696263
12
3.2
12
85
11
51
56
0
0
43
0.99
95698537--95698618
39
2.1
39
97
0
155
25
9
7
57
1.57
95708393--95708474
42
1.9
43
82
2
103
23
25
34
17
1.96
95710302--95710350
22
2.2
23
88
3
73
4
22
0
73
1.00
95710317--95710350
11
3.0
11
91
8
59
0
20
0
79
0.73
95710323--95710375
19
2.8
18
77
5
52
5
18
0
75
0.99
95713612--95713664
26
2.0
26
96
0
97
33
22
3
39
1.72
95714540--95714585
19
2.4
19
81
0
56
58
0
4
36
1.18
95716519--95716663
61
2.3
61
82
8
170
28
26
19
26
1.99
95716765--95716806
22
1.9
22
85
9
59
16
54
2
26
1.54
95719283--95719322
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
95722741--95722789
25
2.0
25
84
8
64
36
12
10
40
1.77
95722752--95722801
25
2.0
25
84
3
66
38
12
6
44
1.66
95724140--95724187
23
2.1
23
92
0
78
31
2
8
58
1.39
95724198--95724233
17
2.1
17
100
0
72
38
5
0
55
1.23
95726680--95726810
64
2.0
64
98
0
253
29
12
20
37
1.89
95728361--95728555
38
5.0
38
85
6
232
31
25
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95733463--95733573
54
2.1
54
84
3
143
21
31
22
24
1.98
95735822--95735868
22
2.1
23
84
4
60
34
2
8
55
1.42
95738834--95738873
20
2.1
19
90
4
62
47
7
0
45
1.31
95738835--95738875
11
4.0
11
84
15
52
51
7
0
41
1.30
95744282--95744499
40
5.5
40
85
2
262
25
27
23
23
2.00
95745747--95745779
5
6.6
5
86
13
50
0
15
0
84
0.61
95752251--95752468
40
5.5
40
84
2
262
26
26
23
23
2.00
95756104--95756140
17
2.2
17
100
0
74
27
5
21
45
1.73
95756138--95756469
164
2.0
165
96
0
612
35
12
12
38
1.82
95757198--95757281
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
95762272--95762326
20
2.7
21
76
21
62
45
7
3
43
1.49
95763180--95763208
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
95766762--95766917
63
2.5
64
82
4
183
31
22
24
21
1.98
95776031--95776079
10
4.4
12
75
19
52
71
4
0
24
1.03
95776031--95776079
16
3.1
16
80
11
64
71
4
0
24
1.03
95776312--95776349
20
1.9
20
84
10
51
50
7
5
36
1.54
95776592--95776629
14
2.7
14
84
11
51
60
10
0
28
1.30
95778267--95778946
178
4.0
168
80
7
613
25
27
18
28
1.98
95778617--95778864
44
5.6
46
70
12
153
25
26
18
29
1.98
95779650--95779678
11
2.6
11
100
0
58
31
27
17
24
1.97
95780317--95780408
46
2.0
46
95
0
166
22
33
9
33
1.87
95787321--95787353
12
2.7
13
90
9
52
9
21
9
60
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95787490--95787536
19
2.5
20
86
6
62
44
8
19
27
1.79
95791208--95791245
14
2.7
14
84
11
51
60
10
0
28
1.30
95793566--95793622
5
10.6
5
80
10
60
40
1
1
56
1.20
95794081--95794132
22
2.4
22
100
0
104
32
11
15
40
1.83
95794461--95794794
130
2.6
131
82
3
385
34
17
18
29
1.94
95800691--95800727
5
7.6
5
88
11
51
16
0
0
83
0.64
95800691--95800727
18
2.0
18
94
5
65
16
0
0
83
0.64
95805130--95805165
11
3.3
11
85
14
56
16
0
0
83
0.65
95805130--95805164
5
6.6
5
93
6
52
17
0
0
82
0.66
95805130--95805165
16
2.2
17
95
5
65
16
0
0
83
0.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343