Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  270  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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244
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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G
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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14
72
26
6
2
64
1.31
89788828--89788877
23
2.2
23
85
0
64
26
8
2
64
1.32
89788846--89788892
23
2.1
22
84
11
60
29
4
4
61
1.34
89796245--89796546
47
6.5
46
78
10
204
29
18
29
22
1.98
89796291--89796539
47
5.3
47
80
8
231
28
17
30
22
1.97
89796300--89796562
140
1.9
142
84
4
363
28
17
30
23
1.97
89803946--89804258
47
6.7
45
76
10
211
29
18
29
23
1.97
89803992--89804258
94
2.8
91
78
8
261
29
17
29
23
1.97
89804980--89805196
84
2.6
83
87
2
301
14
26
30
28
1.95
89804978--89805196
42
5.2
42
81
3
253
14
26
31
28
1.95
89808574--89808837
47
5.7
46
77
7
221
26
20
30
21
1.98
89808668--89808839
93
1.8
94
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6
251
25
22
31
21
1.98
89808574--89808839
140
1.9
141
85
2
365
26
21
30
21
1.98
89808615--89808839
47
4.8
47
80
7
226
25
21
32
21
1.98
89811652--89811689
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
89821983--89822020
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89827882--89828050
46
3.7
44
77
14
146
29
19
28
22
1.98
89827879--89828004
47
2.7
44
81
11
146
28
19
29
22
1.98
89827976--89828097
46
2.6
46
83
7
140
29
16
29
24
1.96
89827924--89828147
47
4.8
47
77
9
192
29
18
29
22
1.97
89829915--89829998
30
2.8
30
87
0
105
29
33
25
11
1.91
89834843--89834908
17
3.8
17
73
13
53
18
6
3
72
1.18
89836526--89836561
6
6.2
6
93
6
65
16
0
0
83
0.65
89836526--89836561
17
2.1
17
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5
63
16
0
0
83
0.65
89837558--89838196
4
159.8
4
89
0
873
44
24
5
25
1.75
89861199--89861332
49
2.7
48
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8
142
23
26
20
29
1.99
89874801--89874947
57
2.6
58
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4
172
32
17
17
32
1.93
89877309--89877387
39
2.0
39
97
0
149
27
17
18
35
1.94
89884618--89884671
26
2.1
26
82
6
65
31
5
0
62
1.18
89887233--89887323
30
3.0
31
80
4
98
30
20
5
42
1.75
89893426--89893583
77
2.1
77
97
0
298
20
15
25
38
1.92
89899740--89899778
20
2.0
20
84
0
51
41
10
7
41
1.68
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29
3.3
29
82
1
131
26
12
31
30
1.93
89916989--89917084
29
3.3
29
79
1
122
27
12
30
30
1.93
89920210--89920267
30
1.9
30
100
0
116
55
20
13
10
1.68
89923670--89923704
18
2.0
17
88
5
52
17
5
0
77
0.96
89924480--89924506
14
1.9
14
100
0
54
18
0
0
81
0.69
89924495--89924595
44
2.3
44
91
5
159
31
2
1
63
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89924494--89924567
18
3.7
18
72
22
58
29
2
2
64
1.21
89924591--89924644
23
2.4
23
87
3
74
29
1
3
64
1.21
89924542--89924679
73
1.9
74
83
8
183
31
2
4
60
1.31
89924541--89924814
49
5.4
51
73
13
165
29
4
5
60
1.38
89938557--89938590
15
2.3
15
100
0
68
52
5
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29
1.61
89940079--89940121
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7.3
6
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79
0
2
18
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17
2.1
17
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0
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52
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30
1.55
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282
2.0
282
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0
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1.96
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7.7
6
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4
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14
0
0
85
0.61
89948610--89948702
29
3.4
28
67
16
70
34
4
2
59
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343