Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95807449--95807549
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75
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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10
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536
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3.1
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223
28
23
15
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12
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2.0
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0
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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3.8
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1.9
100
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16
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25
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0
100
32
12
32
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95965856--95965901
23
2.0
23
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10
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2.1
25
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0
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13
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0
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1.30
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10
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23
30
1.72
95974209--95974253
20
2.2
20
96
0
81
64
0
0
35
0.94
95980634--95980659
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4.3
6
100
0
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34
30
19
15
1.93
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14
2.1
14
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0
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16
0
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1.47
95998250--95998320
35
2.0
35
100
0
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29
33
22
14
1.93
95999112--95999154
12
3.5
12
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6
50
0
9
6
83
0.80
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169
2.0
169
88
0
507
26
23
13
36
1.91
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20
3.2
20
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26
1.81
96013144--96013218
37
2.0
37
100
0
150
38
29
8
24
1.83
96013566--96013800
43
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43
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289
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28
17
23
1.97
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53
2.0
51
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27
1.86
96018344--96018422
7
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30
0
3
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1.10
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32
0
3
63
1.11
96018344--96018397
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2.5
22
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27
0
3
68
1.06
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20
2.2
19
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27
0
5
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1.11
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21
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0
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25
0
19
1.43
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41
2.8
38
81
9
130
29
19
22
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
0
2
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25
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6
22
1.38
96022692--96022741
25
2.0
23
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6
6
22
1.36
96023220--96023339
19
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21
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15
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1.78
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1.83
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17
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0
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12
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2.0
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1.30
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24
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205
2.7
206
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2.0
21
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22
1.85
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1
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0
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2
0
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1.77
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64
3.2
64
62
20
142
29
26
17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96049624--96049910
137
2.1
137
98
0
547
31
25
18
24
1.98
96051691--96051774
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
96055202--96055383
48
3.8
48
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167
28
19
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26
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18
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18
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151
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20
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0
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0.76
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0
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0
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1.81
96079876--96079901
12
2.2
12
100
0
52
42
26
7
23
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343