Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17563428--17563466
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0
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0
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0
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20
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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72
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1.9
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2.2
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20
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2.0
38
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0
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19
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2.0
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0
0
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17
1.9
18
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50
2
0
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2
3
24
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1821
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6
29
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2.8
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54
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2
0
22
0.95
17684502--17685775
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2.1
602
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2
2026
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6
6
29
1.51
17689352--17689526
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3.8
46
77
15
180
29
28
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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21
1.98
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19
23
1.98
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1.40
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2.1
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1
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1.11
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2
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10
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28
2.6
28
85
12
96
39
31
0
28
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17715162--17715214
21
2.5
21
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0
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43
30
0
26
1.55
17715290--17715373
28
3.0
28
72
8
71
42
33
1
22
1.61
17715354--17715408
29
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28
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92
40
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0
14
1.45
17715359--17715429
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2.5
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2
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39
1
15
1.55
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17
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13
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36
0
17
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12
2.8
14
80
16
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35
13
2
48
1.57
17726684--17726735
17
2.8
18
80
16
54
40
1
0
57
1.10
17726688--17726735
18
2.7
17
78
18
53
41
2
0
56
1.11
17726699--17726733
18
1.9
18
88
11
54
40
0
0
60
0.97
17731028--17731062
6
5.8
6
100
0
70
34
17
48
0
1.47
17734194--17734236
9
4.6
9
77
11
50
67
0
0
32
0.91
17734895--17734922
13
2.2
13
100
0
56
39
0
0
60
0.97
17741797--17741897
39
2.6
39
88
0
157
13
23
21
40
1.89
17749730--17749830
39
2.6
39
85
0
148
14
23
21
39
1.91
17749748--17749817
21
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21
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25
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17
21
18
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1.89
17756791--17756826
17
2.1
18
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2
0
44
1.15
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25
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26
30
1.97
17768977--17769073
28
3.5
28
87
6
119
24
13
28
32
1.93
17775760--17775799
19
2.0
20
85
4
55
62
0
22
15
1.32
17777186--17777283
27
3.5
28
87
5
119
24
13
28
33
1.93
17777214--17777296
27
3.0
27
84
5
87
28
12
25
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17781669--17781969
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41
90
0
408
34
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20
22
1.97
17782495--17782556
32
1.9
32
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0
88
20
0
35
43
1.53
17782525--17782579
14
3.9
14
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17
51
20
0
43
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1.52
17782532--17782579
7
6.9
7
82
0
51
18
0
45
35
1.50
17782730--17782788
21
2.8
22
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10
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25
1
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1.60
17783679--17783714
16
2.2
16
100
0
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5
22
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1.77
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19
2.2
19
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21
2
4
70
1.18
17787106--17787228
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2.9
43
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0
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23
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29
29
1.97
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2.0
56
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0
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55
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3
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31
2
0
66
1.04
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20
2.2
20
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40
0
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1.29
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11
3.8
11
90
3
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30
2
0
67
1.03
17797125--17797169
22
2.0
22
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0
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2
0
64
1.06
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5.0
46
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0
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40
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13
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34
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2.1
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0
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20
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27
6
6
60
1.44
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3.0
108
92
0
527
28
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15
34
1.94
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33
4.3
33
71
7
110
32
20
25
20
1.98
17815986--17816163
91
1.9
92
81
1
214
43
14
22
19
1.87
17816043--17816168
46
2.7
46
86
2
155
42
13
23
20
1.87
17819297--17819333
20
1.9
18
89
10
56
35
16
0
48
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17819843--17819907
7
9.6
7
71
18
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53
3
1
41
1.25
17820212--17820243
9
3.8
9
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16
50
0
21
0
78
0.76
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7
4.4
7
100
0
62
58
0
0
41
0.98
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18
2.7
18
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0
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44
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8
38
1.64
17827505--17827549
18
2.5
18
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0
54
33
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17
31
1.94
17827676--17827793
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2.3
51
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137
41
21
20
16
1.90
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20
2.1
19
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0
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1.06
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0
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0
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12
2.1
12
100
0
50
60
0
24
16
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343