Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109885707--109885934
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119
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2.2
193
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0
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46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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28
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
31
0.90
110129846--110129938
18
5.2
18
86
0
132
33
15
23
27
1.95
110129846--110129938
36
2.6
36
91
0
150
33
15
23
27
1.95
110154915--110155038
61
2.0
62
95
1
223
34
8
26
30
1.85
110160837--110160867
9
3.4
9
100
0
62
41
0
9
48
1.36
110161040--110161219
88
2.0
89
91
1
290
30
11
20
37
1.88
110161715--110161769
28
2.0
27
86
13
76
50
1
10
36
1.48
110164033--110164336
39
7.6
39
87
4
376
12
25
24
37
1.90
110164229--110164302
25
3.2
25
68
28
81
17
18
22
40
1.91
110169026--110169080
27
2.0
27
92
0
92
32
18
14
34
1.91
110173030--110173232
46
4.3
46
88
7
289
35
14
21
28
1.92
110172959--110173232
98
2.7
98
90
3
404
35
14
21
28
1.93
110173196--110173341
37
4.0
37
90
1
224
36
15
22
25
1.94
110179293--110179357
10
6.6
10
74
8
53
69
1
0
29
0.98
110179293--110179357
30
2.2
29
89
8
96
69
1
0
29
0.98
110179633--110179671
19
2.2
19
86
9
55
56
5
0
38
1.22
110179730--110179780
21
2.7
20
80
14
63
33
0
3
62
1.13
110183007--110183104
42
2.3
42
92
0
160
45
14
13
26
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110195277--110195311
14
2.4
14
95
4
61
34
8
0
57
1.29
110202891--110202919
14
2.0
15
93
6
51
79
6
13
0
0.93
110205175--110205201
9
3.0
9
100
0
54
11
0
0
88
0.50
110226826--110226866
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
110236316--110236356
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
110245413--110245512
50
2.0
50
94
0
173
30
8
17
45
1.77
110245496--110245622
50
2.5
52
85
5
177
17
8
11
62
1.53
110247119--110247224
51
2.1
51
98
0
203
48
13
7
31
1.70
110258168--110258195
1
28.0
1
100
0
56
0
0
0
100
0.00
110272129--110272166
10
3.5
11
82
17
53
36
0
0
63
0.95
110276588--110276614
11
2.5
11
100
0
54
62
7
7
22
1.46
110278535--110278589
21
2.6
21
91
0
74
12
20
21
45
1.84
110278535--110278583
21
2.3
21
96
0
89
14
22
20
42
1.88
110281516--110281615
47
2.1
47
87
5
141
34
7
25
34
1.83
110282983--110283083
48
2.1
48
96
0
184
22
9
11
55
1.65
110288445--110288499
27
2.0
27
100
0
110
21
29
21
27
1.99
110300665--110302142
7
208.4
7
85
12
1834
13
0
40
45
1.45
110302314--110302390
7
11.1
7
78
12
63
12
2
38
45
1.57
110302325--110302390
15
4.4
14
75
18
62
13
0
37
48
1.43
110302409--110302466
26
2.3
25
82
5
71
13
6
43
36
1.71
110302506--110302535
13
2.3
13
94
0
51
16
3
40
40
1.65
110302720--110302751
16
1.9
17
93
6
57
21
3
37
37
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343

The End!