Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  7  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2417584--2417632
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26
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20
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12
1.79
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30
2.1
30
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0
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53
1
12
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1.48
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2.6
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0
0
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3.0
11
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0
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0
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1.9
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2.3
22
85
0
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64
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10
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1
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2.0
22
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48
2
0
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19
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20
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68
0
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1.09
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27
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1
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15
2.6
17
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14
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0
2
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1.08
2458114--2458190
31
2.5
30
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12
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6
14
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1.71
2460303--2460378
35
2.1
37
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4
102
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3
3
39
1.38
2460870--2461024
40
3.9
39
92
0
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2.5
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20
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65
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5
23
1.37
2479978--2480028
22
2.3
21
90
6
75
64
5
5
23
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2480975--2481594
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4.0
154
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4
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18
2.9
18
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54
25
0
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1.12
2511642--2511688
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2.5
20
89
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48
6
0
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1.28
2517306--2517383
32
2.5
32
75
6
79
28
8
12
50
1.71
2519446--2519497
20
2.9
17
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15
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1
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0
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0
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20
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2.2
17
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46
20
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1.51
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63
33
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2.0
16
93
0
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53
9
0
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1.34
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2.1
30
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9
72
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4
13
40
1.65
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28
2.1
28
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0
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31
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2.0
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2.2
13
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0
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2
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2
2
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2604776--2604826
19
2.8
19
73
5
52
60
3
1
33
1.26
2605039--2605110
32
2.2
32
80
7
83
38
4
2
54
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
28
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0
1
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4.7
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0
0
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62
67
0
0
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0.91
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2.4
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9
52
71
0
0
28
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18
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0
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0
0
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0
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28
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1
0
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0
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20
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6
62
35
2
4
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1
1
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11.2
11
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0
1
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1.15
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0
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13
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0
53
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58
0
35
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2664602--2664660
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1.9
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3
59
0
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1.14
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13
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3
57
0
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1.17
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0
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20
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18
2.3
20
78
17
51
31
2
20
46
1.62
2680935--2680986
20
2.6
20
84
0
68
21
32
30
15
1.94
2681767--2681834
29
2.3
29
83
14
79
47
0
4
48
1.22
2684124--2684185
26
2.3
26
97
2
115
50
0
3
46
1.17
2684141--2684187
14
3.5
14
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21
55
48
0
2
48
1.13
2688321--2688364
23
1.9
23
81
9
54
63
0
13
22
1.29
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1.9
122
80
1
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29
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13
40
1.86
2692379--2692496
59
2.0
59
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0
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28
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28
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0
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1.84
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19
2.2
19
100
0
84
45
4
23
26
1.73
2725946--2726038
18
5.2
18
86
0
123
27
20
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1.95
2725946--2726038
36
2.6
36
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0
150
27
20
17
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1.95
2734205--2734256
27
1.9
27
100
0
104
51
7
11
28
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2734362--2734407
23
2.0
24
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4
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54
0
2
43
1.12
2734362--2734399
12
3.2
12
77
7
51
60
0
0
39
0.97
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33
2.2
33
85
7
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56
9
2
30
1.46
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20
2.0
20
100
0
80
30
30
0
40
1.57
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212
3.0
199
83
8
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29
13
19
37
1.90
2766369--2766734
203
1.8
199
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4
572
30
13
19
36
1.90
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2.0
15
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0
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3
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0
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1.16
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24
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0
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0
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0
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1.47
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0
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0
0
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2.0
44
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0
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29
1.80
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20
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45
0
3
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2.0
45
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2
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2.1
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0
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0
0
60
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0
0
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1.00
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1
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2.0
55
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24
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6
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0
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0
33
33
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7.1
63
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7
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15
1.78
2808815--2809257
127
3.5
127
90
1
658
48
23
12
15
1.78
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10
8.2
10
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18
53
56
2
2
37
1.26
2809607--2809760
19
8.2
19
70
18
67
55
1
5
37
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2809602--2809674
29
2.6
28
82
4
83
58
1
2
36
1.21
2809604--2809761
9
16.8
9
63
18
54
55
1
5
37
1.35
2811017--2811069
9
5.6
9
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8
52
20
0
3
75
0.96
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7
13.9
7
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14
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13
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32
0
18
48
1.54
2813389--2813466
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3.8
20
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1
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0
0
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2.4
12
100
0
58
0
6
24
68
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343