Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  4  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1358292--1358348
28
2.0
28
100
0
114
57
7
10
24
1.56
1362392--1362427
16
2.2
16
90
9
56
25
0
11
63
1.27
1365441--1365485
23
2.0
23
91
8
74
40
6
2
51
1.41
1366598--1366633
17
2.1
17
94
0
63
41
5
0
52
1.24
1366710--1366768
27
2.1
28
81
9
68
64
1
3
30
1.20
1374157--1374233
31
2.5
31
91
4
122
33
3
6
55
1.44
1374157--1374253
31
3.2
31
85
7
94
32
4
7
55
1.46
1380110--1380171
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
1386638--1386666
5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
1389864--1389904
18
2.3
18
87
4
57
65
0
2
31
1.05
1390098--1390135
16
2.3
17
90
4
60
63
0
7
28
1.23
1390145--1390217
3
24.3
3
75
10
69
60
2
5
31
1.34
1390164--1390212
17
2.7
17
82
17
55
61
4
4
30
1.33
1390145--1390212
19
3.6
17
77
16
64
60
2
5
30
1.35
1395966--1396015
14
3.5
15
77
17
54
74
0
0
26
0.83
1398810--1398898
30
2.8
30
84
6
97
28
14
7
49
1.71
1399339--1399483
59
2.5
59
81
2
175
45
15
15
22
1.85
1399757--1399850
47
2.0
47
97
0
179
28
4
18
48
1.66
1399763--1399837
24
3.2
24
60
17
57
26
5
18
49
1.69
1402213--1402263
26
2.0
26
84
3
68
64
3
0
31
1.11
1402225--1402273
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
1403475--1403511
14
2.6
14
95
0
65
43
16
16
24
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1406300--1406333
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
1409046--1409080
17
2.1
17
100
0
70
40
11
0
48
1.39
1409049--1409085
17
2.2
17
90
4
58
48
10
0
40
1.38
1411647--1411708
31
2.0
31
96
0
115
51
8
6
33
1.57
1411881--1411909
14
2.0
15
93
6
51
48
20
0
31
1.50
1417219--1417259
17
2.4
18
80
8
50
14
24
4
56
1.58
1417190--1417243
24
2.2
25
78
15
60
11
22
3
62
1.43
1419495--1419524
15
2.0
15
100
0
60
13
6
6
73
1.24
1419502--1419562
13
4.8
12
76
13
52
8
9
4
77
1.13
1419501--1419565
26
2.5
26
85
5
87
10
9
6
73
1.23
1420785--1420837
23
2.3
23
100
0
106
30
26
20
22
1.98
1420924--1420952
8
3.6
8
100
0
58
34
27
13
24
1.93
1421057--1421095
18
2.2
17
86
13
53
46
20
0
33
1.51
1428094--1428169
23
3.3
23
96
0
143
31
26
21
21
1.98
1428256--1428284
8
3.6
8
100
0
58
34
27
13
24
1.93
1428389--1428427
18
2.2
17
86
13
53
46
20
0
33
1.51
1437016--1437056
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
1438674--1438816
3
47.3
3
72
9
85
28
6
2
62
1.33
1438728--1438775
14
3.1
14
73
21
51
25
10
0
64
1.25
1438685--1438751
35
1.9
35
85
11
93
31
5
0
62
1.19
1438835--1438872
15
2.6
15
91
4
60
23
5
0
71
1.07
1439084--1439132
20
2.6
19
84
9
64
20
4
0
75
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1439090--1439176
7
11.4
7
72
22
52
22
3
1
72
1.07
1441421--1441450
7
4.3
7
100
0
60
56
16
13
13
1.67
1443878--1443904
14
1.9
14
100
0
54
55
22
0
22
1.44
1455211--1455292
43
1.9
43
85
9
114
41
3
4
50
1.41
1466034--1466068
18
1.9
18
94
0
61
31
25
14
28
1.95
1476821--1476876
18
3.3
17
73
22
55
30
0
5
64
1.16
1478086--1478821
107
7.0
106
80
9
631
33
13
13
38
1.85
1478094--1478721
211
2.9
211
78
8
623
32
14
14
38
1.86
1478438--1478462
12
2.1
12
100
0
50
60
0
8
32
1.26
1479977--1480037
29
2.1
28
85
11
79
47
4
0
47
1.23
1482415--1482467
23
2.3
23
93
0
88
56
9
0
33
1.32
1515119--1515296
89
2.0
89
97
0
338
35
18
21
24
1.96
1516819--1516857
20
2.0
20
84
0
51
10
5
10
74
1.21
1516847--1516871
10
2.5
10
100
0
50
20
0
8
72
1.10
1516956--1517017
21
3.0
19
84
11
70
38
1
1
58
1.18
1516969--1517030
21
3.0
20
88
7
70
43
0
0
56
0.99
1516969--1517017
21
2.4
20
93
3
80
38
0
0
61
0.96
1517029--1517090
23
2.9
21
77
18
65
56
3
0
40
1.15
1517029--1517090
22
2.9
21
79
18
65
56
3
0
40
1.15
1517031--1517090
21
2.8
23
74
20
67
56
3
0
40
1.16
1517184--1517260
23
3.2
22
74
15
64
54
2
1
41
1.22
1517179--1517273
49
2.0
48
83
10
122
54
3
1
41
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1517268--1517311
4
10.5
4
90
9
70
77
0
0
22
0.77
1517255--1517317
9
7.0
9
89
8
85
73
1
0
25
0.93
1517179--1517280
50
2.0
50
83
9
127
55
2
0
40
1.21
1517184--1517289
51
2.1
49
79
6
115
59
1
0
37
1.15
1517333--1517366
9
3.8
9
96
0
59
73
5
11
8
1.24
1517332--1517376
9
5.0
9
86
8
56
73
4
13
8
1.23
1531451--1531596
58
2.5
56
79
9
141
23
16
17
42
1.89
1534045--1534133
26
3.6
25
88
10
128
5
0
28
66
1.14
1534032--1534133
26
4.1
26
82
12
99
4
0
29
65
1.13
1538676--1538721
22
2.1
21
84
4
56
39
8
2
50
1.46
1541408--1541472
31
2.1
32
82
8
80
56
7
3
32
1.43
1546124--1546181
30
1.9
30
93
6
100
41
1
24
32
1.65
1546918--1546993
31
2.5
30
80
8
82
27
10
13
48
1.75
1548217--1548442
51
4.7
51
82
12
278
43
13
5
38
1.66
1548217--1548293
22
3.2
22
66
22
55
45
14
5
35
1.67
1548303--1548382
39
2.1
39
97
0
151
43
13
3
38
1.62
1548253--1548433
90
2.0
90
93
0
308
43
13
4
37
1.66
1551190--1551273
22
3.5
22
71
20
69
47
14
3
34
1.61
1551197--1551381
51
3.6
51
91
0
280
42
12
5
39
1.66
1551268--1551346
22
3.3
22
68
21
59
37
12
6
43
1.68
1556884--1556908
12
2.1
12
100
0
50
56
8
0
36
1.29
1561161--1561252
31
3.1
29
69
17
73
38
10
10
40
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1571216--1571251
7
5.1
7
96
0
54
50
0
13
36
1.43
1571210--1571251
14
3.0
14
89
0
57
50
2
14
33
1.56
1582317--1582370
27
2.0
27
100
0
108
33
11
14
40
1.82
1585132--1585173
19
2.2
19
86
0
57
66
7
23
2
1.28
1586713--1586747
15
2.3
15
90
0
52
57
8
0
34
1.29
1595251--1595281
16
2.0
16
93
6
55
38
6
3
51
1.44
1602335--1602365
14
2.2
14
94
0
53
16
0
35
48
1.46
1610046--1610107
31
2.0
31
96
0
115
43
14
22
19
1.87
1618615--1618709
26
3.7
26
70
18
72
45
1
2
51
1.20
1618682--1618715
17
1.9
17
88
5
50
44
0
0
55
0.99
1628007--1628111
52
2.0
52
98
0
201
37
8
15
39
1.78
1630404--1630464
30
2.0
30
93
0
104
13
29
32
24
1.93
1635146--1635257
29
3.9
29
79
5
111
26
32
15
25
1.95
1635153--1635265
58
2.0
57
85
5
156
26
30
14
28
1.95
1635453--1635511
24
2.5
24
80
5
75
11
15
20
52
1.73
1641253--1641310
30
1.9
30
96
0
107
36
13
10
39
1.79
1646428--1646516
39
2.3
39
92
0
151
14
23
23
38
1.92
1646444--1646510
21
3.3
21
68
19
70
13
23
23
38
1.91
1652801--1652857
18
3.2
18
89
0
87
35
17
21
26
1.95
1664653--1664714
18
3.4
18
79
0
70
37
17
11
33
1.86
1664867--1664958
44
2.1
44
83
4
114
32
21
21
23
1.98
1670624--1670782
27
5.9
27
80
11
157
36
22
23
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1670624--1670782
54
3.0
54
86
2
214
36
22
23
18
1.95
1672334--1672441
26
4.2
26
91
0
180
36
25
7
31
1.83
1674842--1674875
5
6.6
5
93
6
59
79
0
2
17
0.86
1679278--1679310
5
6.6
5
100
0
66
81
0
0
18
0.68
1682695--1682759
32
2.0
32
100
0
130
41
9
15
33
1.79
1700620--1700727
26
4.2
26
91
0
180
33
7
23
36
1.83
1710230--1710269
17
2.4
17
86
0
53
32
22
25
20
1.98
1711335--1711390
26
2.2
26
100
0
112
30
7
26
35
1.83
1718328--1718434
26
4.2
26
95
2
198
30
6
26
36
1.82
1718328--1718434
51
2.1
52
96
1
198
30
6
26
36
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343