Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  213  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70165676--70166045
48
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48
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5
406
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19
28
24
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70165661--70166045
144
2.7
144
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542
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19
28
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1.99
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2.0
20
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2.0
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0
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94
0
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44
50
0
5
1.26
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2.2
60
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19
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237
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2.4
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206
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5
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28
3.4
28
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2
104
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2
16
25
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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24
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27
2.9
26
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11
68
44
0
2
52
1.14
70213107--70213250
55
2.6
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175
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1
2
50
1.24
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4
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0
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0
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2.3
23
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3
63
11
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0
62
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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19
2.0
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2.0
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20
28
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1.99
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1
360
25
20
28
25
1.99
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145
1.9
144
88
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409
25
20
28
25
1.99
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18
27
26
1.98
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2.3
131
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19
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1.83
70322147--70322214
33
2.1
32
83
8
84
33
8
22
35
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70323286--70323316
15
2.1
15
100
0
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48
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6
38
1.55
70328764--70328829
33
2.0
33
85
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36
10
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30
1.88
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0
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0
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17
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50
1
0
47
1.11
70338514--70338555
21
2.0
21
86
4
59
30
2
4
61
1.29
70340137--70340219
29
2.7
31
80
12
91
43
12
8
36
1.72
70343937--70343990
25
2.1
26
86
3
74
24
40
0
35
1.55
70348518--70348608
24
3.8
24
81
8
107
40
23
21
14
1.90
70348518--70348608
47
1.9
48
82
10
116
40
23
21
14
1.90
70348518--70348621
47
2.1
48
81
11
115
40
22
23
14
1.90
70351353--70351403
24
2.1
24
92
7
86
43
21
15
19
1.88
70360386--70360531
37
3.9
37
88
0
202
28
30
17
22
1.97
70360677--70360873
98
2.0
96
89
6
299
31
25
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36
1.82
70360677--70360861
48
3.8
48
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4
291
31
25
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36
1.82
70360831--70361071
47
5.1
47
89
0
347
26
28
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1.91
70360924--70361042
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22
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1.94
70369738--70370008
39
7.0
39
90
2
422
25
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23
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1.99
70379971--70380023
27
2.0
26
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28
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45
1.77
70379976--70380033
27
2.1
27
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82
34
18
6
39
1.78
70382326--70382363
19
2.0
19
94
0
67
34
21
2
42
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70389518--70389547
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1.9
15
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23
0
43
1.54
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50
5.6
50
80
5
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33
27
14
24
1.95
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11
2.7
11
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27
0
0
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0.85
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14
3.0
15
80
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6
0
29
1.20
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0
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0
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2.1
18
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1.76
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2.0
80
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0
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1.75
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2.0
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0
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1.94
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2.2
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0
0
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1.9
150
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28
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16
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5
0
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0
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0
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1.00
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25
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3
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0
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0
0
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2.0
18
100
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74
0
17
7
1.05
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46
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0
50
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2.0
64
82
6
157
28
12
21
37
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70463706--70463842
64
2.1
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10
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2.8
17
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3
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68
0
0
31
0.90
70464397--70464444
6
8.2
6
88
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68
0
0
31
0.90
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4.5
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67
0
0
32
0.90
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1
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0
0
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2.9
18
80
12
60
52
0
1
45
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343