Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  83  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27451429--27451550
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1.8
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1
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3.1
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2.4
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3.7
46
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21
20
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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21
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28
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19
27
30
1.98
27508135--27508305
93
1.8
93
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2
308
22
20
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29
1.98
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2.5
40
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1.8
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20
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1.98
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19
1.97
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1.9
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289
28
30
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.68
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1.69
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3.7
46
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18
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1.97
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29
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1.98
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1.99
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21
1.98
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3.3
23
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143
31
26
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27635782--27635897
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2.8
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27
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61
1.40
27683017--27683342
164
2.0
165
94
0
573
25
23
14
37
1.92
27687087--27687256
93
1.8
93
90
0
277
30
29
19
21
1.97
27687081--27687253
46
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46
77
13
183
30
28
19
21
1.98
27689698--27689868
93
1.8
93
88
0
261
29
28
19
21
1.98
27689693--27689859
46
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46
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10
160
31
27
19
22
1.97
27703564--27703677
27
4.2
28
84
4
128
35
21
22
20
1.96
27703564--27703678
55
2.1
53
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3
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21
22
20
1.96
27703778--27703828
26
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26
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4
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15
23
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1.95
27711553--27711759
21
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21
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45
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1.85
27711541--27711758
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17
1.84
27711557--27711757
63
3.2
63
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5
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45
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17
1.85
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21
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1.51
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39
2.1
39
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0
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26
1.93
27721483--27721612
50
2.6
49
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3
190
29
29
17
23
1.97
27721483--27721669
101
1.9
99
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6
252
27
29
17
25
1.98
27727089--27727272
40
4.6
40
84
2
253
25
26
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
79
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4
275
25
26
23
24
2.00
27729683--27729787
35
3.0
35
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0
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20
25
17
37
1.94
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58
1.9
57
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132
24
32
14
28
1.95
27733410--27733446
16
2.3
16
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0
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5
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21
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1.98
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1.97
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1.99
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22
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1.99
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1.97
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42
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18
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30
1.98
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203
23
18
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1.98
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2.0
26
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102
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0
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1.83
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7
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18
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0
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1.06
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20
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0
0
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1
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1.41
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2.0
28
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0
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18
100
0
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16
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40
5.1
40
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1
295
25
28
22
23
1.99
27795351--27795542
40
4.8
40
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25
28
23
22
2.00
27799818--27799863
20
2.4
19
85
7
58
23
2
23
50
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27803343--27803376
17
2.0
17
100
0
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5
23
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1.78
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15
2.0
15
100
0
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13
20
33
1.91
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2.1
35
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6.5
55
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16
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28
1.97
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1.9
165
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432
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29
1.96
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31
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20
22
22
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21
2.0
20
85
10
53
17
12
23
46
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343