Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  281  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93156982--93157068
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35
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1.95
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2.5
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0
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2.0
23
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16
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34
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28
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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51
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13
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1.92
93210282--93210315
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4.7
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26
1.69
93210300--93210474
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4.2
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26
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3
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20
2.0
20
90
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27
0
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0
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1.26
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71
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0
0
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63
0
0
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2.1
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2.2
25
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1.9
30
100
0
114
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15
24
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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2
190
26
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1.94
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1.14
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2.1
76
94
4
279
34
6
5
53
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93348990--93349054
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19
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50
4
1
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1.32
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2.0
484
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1
1528
36
18
16
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1.92
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32
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0
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0
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2.0
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83
10
88
7
14
8
69
1.35
93374834--93374872
20
2.0
20
89
0
60
17
28
0
53
1.44
93374839--93374881
20
2.2
20
86
0
59
20
27
2
48
1.62
93380074--93380111
20
1.9
20
84
10
51
34
2
5
57
1.35
93385312--93385376
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2.0
32
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0
130
50
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18
15
1.78
93389788--93390004
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121
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4
332
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11
15
30
1.84
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26
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49
1
7
42
1.40
93392634--93392959
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2.0
160
94
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571
33
12
18
36
1.88
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1.89
93407257--93407460
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20
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20
1.98
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28
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27
1.30
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38
3
1
56
1.27
93421465--93421526
31
2.0
31
87
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40
4
0
54
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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0
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29
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24
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0
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16
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2.2
24
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0
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24
2.2
24
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0
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1.49
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21
2.0
21
85
0
57
11
0
28
59
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93472961--93473087
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1
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2.1
47
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37
10
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42
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2.1
15
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16
0
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12
0
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21
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28
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29
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1.92
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3.8
55
92
5
330
31
13
18
36
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343