Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85811119--85811170
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76
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2.7
23
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38
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8
25
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
50
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31
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378
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31
1.95
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4.7
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4.6
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224
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1.98
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93
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1.98
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7
170
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16
22
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
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5
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2.3
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280
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1.99
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99
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265
29
12
24
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86066032--86066081
10
5.0
10
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22
10
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66
1.32
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11
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0
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0
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24
3
41
1.71
86080480--86080792
155
2.0
155
100
0
626
26
23
8
41
1.83
86081349--86081596
50
4.8
50
84
4
282
20
29
24
26
1.99
86081348--86081596
100
2.4
105
88
6
357
20
28
24
26
1.99
86081691--86081722
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
86081934--86081990
30
1.9
29
85
3
78
31
24
1
42
1.65
86087167--86087411
50
4.8
50
82
8
266
20
29
24
26
1.99
86087166--86087411
97
2.4
102
85
8
315
20
29
23
26
1.99
86087744--86087799
29
1.9
29
88
0
85
32
21
3
42
1.70
86094742--86094990
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
86094741--86094990
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
86095085--86095116
13
2.5
13
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0
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0
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89
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1.71
86098662--86098696
17
2.1
17
88
0
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45
5
5
42
1.51
86106091--86106121
16
1.9
16
93
0
53
51
0
0
48
1.00
86106217--86106263
15
3.1
15
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6
51
31
2
4
61
1.27
86106217--86106264
16
3.1
15
79
8
53
31
2
4
62
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86109052--86109293
50
4.8
50
77
3
225
31
26
16
24
1.97
86109044--86109244
101
2.0
101
91
0
321
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26
18
24
1.98
86111796--86111873
29
2.6
32
75
15
78
32
6
0
61
1.21
86114402--86114435
11
3.0
11
91
4
50
2
11
0
85
0.71
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7
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17
0
0
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0.67
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18
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26
1.98
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2.2
132
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0
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19
23
28
1.98
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2.2
178
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0
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27
1.99
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178
2.6
177
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28
20
22
28
1.98
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2.7
16
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14
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0
0
70
0.87
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4.0
23
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15
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15
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2
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51
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0
36
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15
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15
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2
89
36
0
12
50
1.40
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17
2.1
17
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10
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37
0
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1.55
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21
2.3
21
89
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73
14
26
26
34
1.94
86132479--86132542
21
3.0
21
86
0
83
14
23
26
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1.93
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19
2.8
19
76
2
52
67
1
3
26
1.18
86139943--86139983
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
86143639--86143678
18
2.2
18
100
0
80
50
17
7
25
1.72
86160154--86160195
22
1.9
22
85
0
57
35
4
14
45
1.66
86164423--86164479
30
1.9
30
82
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47
3
0
49
1.18
86167162--86167201
3
13.3
3
100
0
80
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86167288--86167324
18
2.1
18
94
0
65
24
2
0
72
0.97
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29
2.1
31
82
11
76
12
16
43
27
1.84
86173412--86173503
34
2.7
34
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116
32
4
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45
1.68
86174064--86174102
20
2.0
19
95
5
69
46
5
7
41
1.55
86174440--86174473
17
1.9
17
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50
47
0
0
52
1.00
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5.6
39
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0
245
34
17
31
15
1.92
86178831--86178982
19
7.8
19
66
4
79
32
18
33
15
1.92
86178782--86178993
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2.7
78
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0
271
33
17
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16
1.92
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2.0
26
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70
40
9
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38
1.74
86188485--86188522
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343