Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A10 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  343  ( 41150 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21396317--21396358
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0
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36
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17
18
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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16
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29
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20
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3.8
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20
29
29
1.97
21489743--21489916
95
1.8
93
92
4
296
20
20
29
28
1.98
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2.0
21
100
0
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18
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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20
18
1.97
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2.2
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81
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29
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35
1.82
21511329--21511385
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1.9
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29
24
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38
1.82
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104
2.6
104
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457
30
30
20
18
1.96
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2.2
29
81
10
76
29
28
6
35
1.82
21518722--21518778
30
1.9
30
85
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80
29
24
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1.82
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67
34
23
1
40
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21588086--21588132
24
1.9
25
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4
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65
4
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1.11
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20
2.3
21
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0
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1.99
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28
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25
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25
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0
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43
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2.5
25
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20
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2.0
14
100
0
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0
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0
9
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1.14
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28
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2.0
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34
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22
2.0
23
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17
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3
3
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1.11
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20
2.0
20
85
0
55
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26
0
63
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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0
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2.7
24
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0
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24
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25
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0
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1.40
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2.1
60
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182
52
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1.48
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1.84
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0
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11
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0
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7
0
0.75
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14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21751634--21751695
29
2.1
29
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0
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27
0
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0
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1.55
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50
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2
1
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0
0
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2.0
22
82
13
54
18
2
31
47
1.61

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343