Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79089860--79089907
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0
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122
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2.0
237
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1.98
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1.9
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1.98
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1.97
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2.3
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22
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20
2.0
20
85
0
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4
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36
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
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2.2
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1.9
30
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58
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
1.97
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2.9
45
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18
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32
1.96
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2.0
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84
4
221
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16
24
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2.0
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0
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0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79331989--79332027
17
2.3
17
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71
0
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17
1.12
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2.1
28
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1.33
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32
20
19
28
1.97
79333131--79334251
327
3.4
325
89
4
1555
31
20
19
28
1.97
79333854--79334042
92
2.1
88
86
6
272
33
17
19
29
1.95
79333954--79334331
77
4.9
75
84
7
474
30
23
16
28
1.97
79333954--79334314
156
2.3
151
89
6
587
30
24
16
27
1.97
79346724--79346772
11
4.2
11
80
12
53
57
4
0
38
1.18
79347400--79347439
11
3.5
11
87
12
55
27
0
2
70
1.01
79347827--79347877
26
2.0
26
100
0
102
3
1
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54
1.30
79354266--79354296
6
5.2
6
100
0
62
16
0
48
35
1.46
79354815--79354847
6
5.5
6
100
0
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33
48
0
18
1.48
79356966--79357054
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17
5
35
1.74
79356971--79357067
51
1.9
51
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0
140
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1.75
79359942--79360078
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1.72
79360360--79360452
28
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29
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18
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4
2
60
1.28
79360326--79360451
59
2.0
60
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146
33
6
3
56
1.43
79371818--79371843
11
2.4
11
100
0
52
76
0
7
15
0.99
79372921--79372974
27
2.0
26
82
10
65
50
5
1
42
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79379415--79379734
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6.7
47
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9
321
20
25
15
39
1.91
79379530--79379622
30
3.2
30
64
27
83
17
26
17
38
1.91
79379526--79379639
56
2.0
56
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0
219
19
28
15
36
1.92
79379480--79379685
102
2.0
102
89
1
315
19
26
15
38
1.91
79379434--79379731
148
2.0
148
88
1
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20
25
14
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1.90
79383273--79383326
3
18.0
3
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1
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1
1.14
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15
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0
0
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2.1
37
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0
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1.95
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2.3
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0
0
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20
0
5
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1.01
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3.8
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21
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2.3
93
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0
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1.98
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46
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7
186
29
27
20
22
1.98
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1.9
59
100
0
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1.93
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3.0
131
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1.85
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1.62
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1.9
19
88
0
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8
0
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1.13
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2.0
86
96
0
317
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1.57
79428474--79428520
25
2.0
25
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53
4
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1.60
79433254--79433330
40
1.9
40
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0
118
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29
2.9
29
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29
2.5
29
90
4
110
26
13
31
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79445662--79445722
30
2.0
31
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1.91
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2.0
53
100
0
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1.90
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1.9
16
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0
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0
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2.0
20
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0
53
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22
0
40
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24
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20
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79454104--79454304
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1.94
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2
175
29
33
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18
1.95
79480956--79481039
42
2.1
40
88
6
125
25
32
19
23
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343