Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  268  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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28
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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1.13
88938623--88938711
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108
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2.0
52
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14
30
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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26
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1.98
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14
19
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342
22
28
19
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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30
1.97
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22
28
19
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55
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21
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1.88
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21
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1.98
89015171--89015535
143
2.5
142
86
4
493
31
20
21
26
1.98
89015171--89015599
143
3.0
139
82
6
466
31
19
20
27
1.97
89017108--89017183
25
3.0
25
83
9
100
27
6
3
61
1.38
89017242--89017290
21
2.3
21
86
13
66
18
2
6
73
1.14
89017312--89017361
22
2.3
22
85
0
64
32
4
4
60
1.34
89017195--89017462
26
10.5
25
70
13
163
29
4
3
61
1.34
89019621--89019695
21
3.5
21
82
12
82
74
0
2
22
0.94
89019626--89019700
13
5.6
13
77
16
73
74
0
2
22
0.94
89019626--89019673
8
5.8
8
82
7
60
72
0
2
25
0.95
89019621--89019693
29
2.5
29
84
6
94
73
0
2
23
0.95
89029781--89029818
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
89030048--89030218
93
1.8
93
92
0
288
28
29
21
21
1.98
89030043--89030220
46
3.8
46
78
10
200
28
28
20
21
1.98
89031534--89031592
10
5.9
10
74
7
57
67
1
8
22
1.26
89034731--89034891
87
1.9
87
94
0
286
36
16
9
38
1.80
89038270--89038306
13
2.8
14
88
8
51
62
0
0
37
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89042578--89042743
9
17.6
9
67
20
65
57
2
2
37
1.25
89042543--89042762
28
7.9
28
72
16
111
60
2
2
35
1.24
89043168--89043239
9
8.5
8
71
27
51
23
5
0
70
1.08
89043168--89043229
24
2.4
24
84
10
70
24
4
0
70
1.06
89043192--89043259
8
7.7
9
79
9
61
22
4
0
73
1.01
89043198--89043258
27
2.3
24
81
15
68
22
4
0
72
1.04
89043217--89043259
19
2.2
20
87
4
61
18
6
0
74
1.04
89043217--89043259
20
2.2
19
84
12
52
18
6
0
74
1.04
89048876--89048926
24
2.1
24
92
0
84
35
1
39
23
1.66
89050337--89050448
27
4.2
26
82
7
125
16
24
23
36
1.94
89056665--89056715
24
2.1
24
88
0
75
37
1
37
23
1.66
89058144--89058236
27
3.4
26
82
8
114
18
24
19
37
1.94
89064052--89064098
24
2.0
24
84
16
62
51
17
0
31
1.46
89064769--89064826
20
2.9
20
71
5
55
3
29
1
65
1.19
89064856--89064897
5
8.4
5
100
0
84
59
0
0
40
0.97
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20
3.0
19
82
5
62
43
0
31
24
1.54
89077745--89077900
46
3.3
46
78
12
133
23
25
19
31
1.98
89077780--89077902
46
2.7
45
82
7
142
21
25
20
32
1.98
89080651--89080851
92
2.2
93
93
0
341
26
16
21
35
1.95
89084275--89084320
18
2.4
19
85
7
58
58
2
15
23
1.48
89084526--89085077
272
2.0
272
88
0
809
36
15
16
31
1.90
89094656--89094871
49
4.5
49
75
15
227
25
18
26
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89096337--89096560
40
5.6
40
85
6
283
25
25
23
25
2.00
89096337--89096560
83
2.8
80
85
5
283
25
25
23
25
2.00
89110012--89110080
36
1.9
36
96
0
129
43
18
11
26
1.84
89115984--89116038
24
2.2
24
80
3
65
41
10
1
45
1.50
89119692--89119766
37
2.1
36
82
12
91
41
1
2
54
1.23
89123817--89123924
37
2.9
36
79
16
116
38
2
3
54
1.33
89123817--89123892
11
6.8
11
68
24
52
39
2
2
55
1.28
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3.0
74
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2
338
22
13
14
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1.79
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26
2.0
26
100
0
104
34
15
3
46
1.64
89129910--89129963
26
2.0
27
89
3
83
11
20
22
46
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343