Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  303  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98808793--98808831
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2.0
21
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0
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0
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1.41
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100
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20
50
28
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1.28
98847660--98847740
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3.4
23
83
6
83
30
2
4
61
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.05
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2.6
23
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14
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33
4
1
59
1.28
98847965--98848047
37
2.3
35
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2
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1.29
98848167--98848205
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2.0
20
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0
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15
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20
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1.96
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10
165
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21
23
20
1.97
98855786--98856198
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12
153
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22
22
1.97
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2.7
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3
140
29
16
24
29
1.96
98857974--98858042
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1.28
98857970--98858050
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83
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2
4
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1.30
98858262--98858331
2
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0
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2
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1.28
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37
2.2
37
82
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1.31
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1
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16
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2.0
41
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20
1.98
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4
52
1.39
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20
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24
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3
67
1.27
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23
2.0
23
100
0
92
26
17
13
43
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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0
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1
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161
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1.88
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4.5
43
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18
23
25
1.97
98896228--98896641
132
3.1
132
85
2
537
32
19
22
24
1.97
98896795--98896901
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2.3
46
85
3
135
33
10
28
27
1.89
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1.9
20
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0
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23
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4
3
58
1.33
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19.8
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17
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59
1.35
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19
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20
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32
3
2
62
1.24
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3.5
14
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30
4
2
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1.23
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19
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0
0
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0
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1.21
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2.5
32
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10
81
60
2
0
37
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98928366--98928404
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56
5
0
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14
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32
17
17
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0
0
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28
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29
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13
88
43
0
0
56
0.99
98933860--98933945
18
4.7
17
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16
57
61
1
1
36
1.11
98933859--98933945
20
4.7
19
74
13
74
62
1
1
35
1.11
98934634--98934697
25
2.5
27
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17
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65
1
1
31
1.11
98946473--98946563
33
2.8
33
93
0
155
17
8
42
30
1.80
98955759--98955808
23
2.2
22
85
3
64
44
0
6
50
1.26
98956111--98956173
30
2.1
30
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0
99
25
4
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58
1.51
98957104--98957152
22
2.5
19
81
15
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22
4
2
71
1.13
98959092--98959125
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2.1
16
94
0
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0
0
47
1.00
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53
2
0
43
1.13
98966480--98966551
21
3.6
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1.85
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2.0
40
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5
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1.69
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1.9
63
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3
172
41
24
7
26
1.81
98972196--98972238
12
3.6
12
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12
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60
9
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23
1.51
98972196--98972238
18
2.4
18
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0
59
60
9
6
23
1.51
98977493--98977629
51
2.7
51
80
0
175
39
6
13
40
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98980501--98980638
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2.7
51
79
0
168
39
6
12
42
1.68
98985500--98985525
13
2.0
13
100
0
52
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0
30
30
1.58
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30
2.3
32
80
9
83
48
2
18
30
1.62
98989332--98989364
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
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138
2.5
138
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2
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20
24
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41
1.89
98989650--98990001
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7.7
46
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3
485
20
24
13
40
1.89
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6
6.3
6
100
0
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0
0
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29
1.98
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42
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21
27
20
31
1.98
98996249--98996426
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2.1
84
93
0
302
23
26
20
30
1.98
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0
2
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0.77
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17
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80
0
7
12
0.91
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11
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11
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14
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83
0
2
13
0.74
99000578--99000617
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2.4
16
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12
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85
0
2
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20
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35
1.86
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2.0
27
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15
100
0
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40
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1.78
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2.0
61
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3
190
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18
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13
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10
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12
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12
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7
58
53
9
14
23
1.69
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6
7.7
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0
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15
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17
1.37
99014130--99014196
18
3.7
18
89
0
98
59
13
5
20
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99014133--99014196
6
10.7
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12
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20
1.53
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1.9
16
93
0
53
51
22
3
22
1.62
99018188--99018253
19
3.2
21
87
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36
19
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1.84
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19
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15
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1.83
99018205--99018332
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4
211
35
14
11
38
1.83
99018205--99018338
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7
207
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175
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0
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19
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28
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1.83
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25
2.0
25
96
0
91
22
24
26
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343