Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
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This is table  19  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6625531--6625570
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0
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0
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0
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0
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3.2
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0
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6635664--6635716
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2.0
26
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21
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3.8
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2.0
84
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2.4
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180
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2.1
100
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0
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6643975--6644380
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4
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16
24
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2.0
25
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516
100
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2074
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13
22
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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10
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0
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0
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12
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13
0
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1.42
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14
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2.7
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13
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60
1
0
37
1.08
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5
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2
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0
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1
1
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18
2.0
18
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0
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36
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2.0
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53
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5
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1.37
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34
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25
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1
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2
0
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2.1
17
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5
54
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0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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84
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2.6
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0
12
48
1.40
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22
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2
73
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5
0
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1.24
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2.1
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18
9
33
1.83
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2.3
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5
221
38
18
8
33
1.82
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2.0
22
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19
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2
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11
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1.53
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4.0
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100
0
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0
0
37
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6781869--6781916
12
3.8
12
79
15
60
22
0
14
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1.32
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2.1
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0
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2
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2.0
20
100
0
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10
100
0
50
72
0
16
12
1.13
6804154--6804210
30
1.9
29
89
3
87
73
0
8
17
1.07
6807958--6808015
27
2.1
27
81
12
66
46
10
1
41
1.48
6809115--6809271
80
2.0
80
94
0
278
26
8
12
52
1.67
6815989--6816174
73
2.5
73
99
0
363
40
24
6
27
1.80
6816175--6816203
3
9.7
3
100
0
58
68
0
0
31
0.89
6820420--6820678
73
3.5
73
99
0
509
40
25
6
27
1.79
6834596--6834636
21
2.0
21
86
9
59
48
31
7
12
1.68
6835395--6835452
25
2.3
25
81
0
71
34
20
25
18
1.96
6837736--6837781
21
2.1
22
88
4
67
26
19
19
34
1.96
6837911--6837979
34
2.0
34
97
0
129
26
21
24
27
1.99
6838628--6838705
40
2.0
40
84
5
104
33
32
14
20
1.92
6839700--6839759
19
2.9
20
72
16
59
66
3
26
3
1.23
6843264--6843335
37
1.9
38
88
2
110
19
33
9
37
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6847896--6847983
41
2.2
40
89
4
140
42
14
15
27
1.87
6848843--6848924
33
2.5
33
89
2
128
17
29
30
23
1.97
6849510--6849562
17
3.1
17
79
17
56
71
3
24
0
1.02
6851428--6851605
21
8.5
21
74
9
94
46
15
20
17
1.84
6851428--6851566
42
3.3
42
77
3
129
46
15
19
17
1.84
6855725--6855784
28
2.1
29
81
9
70
43
3
23
30
1.70
6856326--6856453
47
2.7
46
80
2
130
22
18
25
32
1.97
6858920--6858972
18
2.8
19
88
5
90
35
13
13
37
1.83
6858920--6858983
18
3.2
22
84
10
70
39
10
14
35
1.81
6859265--6859298
18
1.9
17
88
5
50
29
0
0
70
0.87
6861074--6861134
31
2.0
31
100
0
122
26
16
32
24
1.96
6871100--6871472
78
4.8
78
90
1
577
32
19
23
25
1.97
6871502--6871685
45
4.1
45
88
1
244
30
13
29
26
1.93
6871495--6871685
89
2.1
90
86
1
267
30
12
30
26
1.93
6872038--6872101
17
3.6
17
83
8
83
39
10
14
35
1.81
6872030--6872108
35
2.2
37
84
13
112
39
8
16
35
1.80
6872030--6872101
19
3.9
19
85
10
114
38
9
15
36
1.80
6872030--6872124
17
4.8
22
82
12
70
37
8
15
37
1.78
6873835--6873886
25
2.1
25
85
0
68
38
15
9
36
1.80
6875611--6875648
18
2.1
18
95
0
67
10
7
23
57
1.58
6878442--6878475
17
2.0
17
88
0
50
0
14
5
79
0.91
6878849--6878890
21
2.0
21
95
0
75
23
7
16
52
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6891619--6891846
46
5.0
46
89
1
305
22
23
14
39
1.91
6903951--6904000
24
2.0
26
88
7
77
54
0
8
38
1.30
6903937--6904004
26
2.5
28
79
13
79
57
1
5
35
1.32
6904167--6904233
25
2.6
25
81
6
73
59
4
4
31
1.37
6905265--6905307
18
2.4
18
92
7
70
76
0
4
18
0.95
6914098--6914153
29
1.9
29
96
0
103
50
0
16
33
1.45
6916471--6916505
13
2.8
12
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4
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2
25
0
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1.00
6916727--6916755
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2.6
11
100
0
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1.81
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29
100
0
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20
0
31
1.50
6919315--6919381
23
2.8
24
69
15
66
40
2
1
55
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343