Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  62  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20080065--20080142
29
2.7
29
82
15
99
26
15
29
28
1.96
20080095--20080424
174
1.9
175
91
2
547
30
14
23
31
1.94
20088377--20088454
29
2.7
28
84
11
104
25
15
30
28
1.96
20088407--20088736
174
1.9
175
91
2
547
30
14
23
31
1.94
20092212--20092238
14
1.9
14
100
0
54
62
0
7
29
1.22
20099771--20099803
16
2.1
16
100
0
66
24
0
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30
1.53
20101507--20101563
29
1.9
30
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3
98
49
14
7
29
1.69
20102095--20102124
14
2.1
14
100
0
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10
26
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20107292--20107355
24
2.6
24
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20
21
29
1.98
20107315--20107383
24
2.9
24
82
0
84
23
20
21
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1.96
20107388--20107452
25
2.6
25
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30
24
21
23
1.99
20119408--20119503
41
2.4
40
82
1
111
26
17
28
28
1.98
20119492--20119627
70
1.9
70
92
0
227
30
15
25
28
1.96
20125836--20125984
74
2.0
74
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1
201
40
17
8
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1.80
20132661--20132728
34
2.0
34
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0
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25
19
22
33
1.97
20141041--20141091
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2.0
25
100
0
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4.0
47
84
0
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17
16
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1.90
20142689--20142747
29
2.0
30
90
3
93
47
15
8
28
1.74
20143714--20143780
16
4.2
16
80
3
73
41
5
25
26
1.78
20143960--20144081
58
2.1
58
86
3
165
51
3
0
44
1.23
20145865--20145921
27
2.1
28
90
3
89
42
7
7
43
1.58
20146019--20146050
17
2.0
17
88
11
50
59
6
3
31
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20146180--20146218
17
2.3
17
86
8
53
69
5
2
23
1.21
20146288--20146340
19
2.7
20
77
11
56
60
0
1
37
1.08
20146294--20146356
21
2.8
23
75
18
62
58
0
1
39
1.07
20146427--20146468
14
3.0
14
76
13
50
38
0
7
54
1.28
20146514--20146541
13
2.2
13
100
0
56
46
7
0
46
1.30
20146713--20146763
16
3.2
16
94
0
84
19
13
13
52
1.73
20150662--20150707
21
2.0
24
88
12
71
21
13
4
60
1.49
20159522--20159575
25
2.2
24
78
12
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7
3
22
1.33
20168883--20168915
7
4.7
7
100
0
66
15
0
45
39
1.46
20178773--20178949
40
4.4
40
82
4
207
27
27
20
23
1.99
20199850--20199911
31
2.0
31
100
0
124
35
16
6
41
1.74
20206898--20206933
17
2.1
18
90
10
58
44
0
5
50
1.25
20206910--20206956
24
2.0
24
83
8
60
38
2
6
53
1.39
20219731--20219807
21
3.6
21
69
10
66
27
24
10
37
1.88
20219727--20219812
43
2.0
43
100
0
172
25
23
11
39
1.88
20220897--20220955
29
2.1
28
90
3
91
23
6
16
52
1.68
20224969--20225001
16
2.1
16
100
0
66
24
6
36
33
1.80
20226856--20226973
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3.0
40
96
0
209
27
29
20
22
1.98
20230849--20231050
58
3.5
57
87
4
271
31
19
25
23
1.98
20231177--20231307
67
2.0
66
88
8
194
22
15
32
30
1.94
20232546--20232579
14
2.3
15
95
5
61
76
0
0
23
0.79
20233236--20233272
18
2.1
18
100
0
74
32
5
5
56
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20238011--20238103
44
2.1
44
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4
114
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23
5
35
1.78
20238085--20238139
16
3.4
16
84
0
74
27
29
7
36
1.84
20238363--20238443
29
2.7
30
84
5
101
45
14
8
30
1.75
20238839--20238971
54
2.5
55
80
7
139
27
27
21
23
1.99
20240652--20240768
18
6.5
18
87
5
157
35
17
10
36
1.83
20240652--20240768
35
3.3
35
91
3
171
35
17
10
36
1.83
20241165--20242298
207
5.5
207
94
0
1874
29
23
17
29
1.97
20242417--20242622
84
2.5
84
87
4
308
23
22
22
31
1.99
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7
9.4
7
78
16
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3
13
0
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3
14
0
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0.82
20243585--20243634
23
2.2
23
85
7
66
4
14
0
82
0.82
20243576--20243635
10
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9
80
16
59
3
13
0
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0.77
20245345--20245425
24
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24
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25
23
20
29
1.99
20245475--20245541
20
3.3
20
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4
100
32
20
11
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1.90
20245475--20245530
11
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11
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32
21
12
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22
21
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1.98
20251839--20251933
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2.0
49
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151
26
22
21
30
1.98
20251983--20252029
20
2.3
20
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78
34
19
12
34
1.89
20258781--20258898
35
3.3
35
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182
37
14
11
37
1.81
20265184--20265219
17
2.2
17
95
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11
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1.38
20270204--20270237
18
2.0
17
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11
52
47
2
11
38
1.55
20271303--20271431
50
2.5
51
87
5
190
35
15
22
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20271407--20271585
31
5.8
31
90
3
281
27
20
26
25
1.99
20271407--20271575
92
1.8
93
92
1
286
28
18
27
24
1.98
20271407--20271585
61
2.9
61
92
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288
27
20
26
25
1.99
20271612--20271774
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46
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147
29
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26
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1.96
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2.7
42
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151
29
14
27
27
1.95
20272872--20272951
20
4.2
20
87
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121
12
40
23
23
1.89
20272864--20272951
37
2.3
37
86
7
115
13
38
21
26
1.91
20272894--20272948
17
3.1
17
92
7
83
10
38
23
27
1.88
20274106--20274284
83
2.2
83
88
4
272
22
24
17
34
1.96
20275531--20275630
51
2.0
51
86
4
139
33
29
16
22
1.95
20278478--20278520
16
2.7
16
82
10
52
76
6
0
16
0.99
20283379--20283437
29
2.0
30
86
3
84
49
15
6
28
1.70
20289478--20289549
5
13.8
5
77
11
65
19
4
0
76
0.95
20289477--20289549
30
2.5
29
86
4
94
19
5
0
75
0.99
20289656--20289761
42
2.5
42
84
0
131
32
33
9
24
1.87
20290550--20290762
118
1.8
118
91
0
354
22
15
32
30
1.95
20296539--20296615
22
3.5
22
75
8
77
33
10
16
38
1.83
20297432--20297457
12
2.2
12
100
0
52
23
0
7
69
1.14
20297441--20297487
24
1.9
25
86
4
69
31
0
6
61
1.21
20297810--20297919
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
20299403--20299455
26
2.0
26
85
7
72
37
18
15
28
1.91
20302735--20302795
21
3.0
21
85
9
72
18
3
3
75
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20302811--20302855
18
2.5
19
86
13
69
33
0
0
66
0.92
20307574--20307613
19
2.1
19
90
0
62
2
25
0
72
0.97
20308622--20308697
40
1.9
40
86
0
107
18
13
34
34
1.89
20315316--20315645
94
3.5
94
87
0
446
33
18
21
26
1.96
20315764--20315942
44
3.9
44
69
16
105
31
16
20
30
1.95
20315767--20315946
94
1.9
94
86
0
252
31
16
20
31
1.95
20315767--20315978
94
2.3
94
82
4
250
30
17
20
31
1.95
20315997--20316499
45
11.3
44
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7
230
35
15
17
31
1.92
20316002--20316492
134
3.7
134
80
4
497
35
15
17
30
1.92
20321384--20321467
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
20343072--20343154
41
2.0
41
97
0
157
45
15
12
26
1.81
20344680--20344706
9
3.0
9
100
0
54
11
33
0
55
1.35
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16
2.9
14
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12
52
75
2
0
22
0.92
20347155--20347216
30
2.1
30
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11
74
46
16
11
25
1.80
20347170--20347226
29
1.9
30
85
3
80
47
17
8
26
1.77
20348271--20348379
29
3.8
29
71
9
87
25
6
2
65
1.30
20348286--20348356
15
4.9
14
73
19
56
26
7
1
64
1.27
20348337--20348404
23
2.8
25
76
13
70
25
7
0
67
1.16
20348349--20348396
15
3.1
15
87
6
60
22
8
0
68
1.16
20348730--20348819
44
2.0
44
97
0
171
22
8
8
60
1.55
20348740--20348814
22
3.3
23
73
14
84
22
6
9
61
1.50
20355365--20356877
44
34.5
43
62
16
196
33
21
23
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20355418--20357854
88
27.7
88
85
1
2978
33
20
23
22
1.97
20358213--20358244
5
6.4
5
100
0
64
18
0
0
81
0.70
20358795--20358863
29
2.3
29
79
20
81
28
7
0
63
1.21
20358755--20358898
44
3.3
44
82
13
154
27
7
1
63
1.30
20358798--20358863
15
4.5
15
85
14
93
28
6
0
65
1.17
20358799--20358873
15
4.7
15
81
12
62
28
5
0
66
1.13
20358799--20358881
21
3.9
22
77
16
95
27
6
0
66
1.15
20359002--20359119
25
4.7
25
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11
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31
5
4
59
1.38
20365619--20365743
64
2.0
64
88
3
189
33
16
14
35
1.89
20365818--20365924
44
2.5
44
89
4
155
33
20
19
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343