Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  75  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24498894--24498971
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1.9
41
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10
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28
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24
1.99
24520887--24520942
22
2.6
22
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25
26
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14
1.94
24520887--24520935
20
2.3
20
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6
62
26
30
32
10
1.89
24521788--24521843
6
9.3
6
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5
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1
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1.05
24524715--24524755
22
1.9
22
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21
31
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7
1.81
24528796--24528876
25
3.2
25
71
11
76
30
20
28
19
1.97
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2
138
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2.0
37
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0
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1.9
159
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20
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19
12
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2.1
50
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1.86
24563155--24563261
50
2.1
50
82
3
135
20
11
28
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1.87
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40
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25
1.99
24570848--24571030
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25
27
21
25
1.99
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40
4.6
40
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6
221
24
28
22
24
1.99
24579002--24579182
79
2.3
80
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24
28
22
24
2.00
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50
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2.2
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1.41
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7.1
40
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414
26
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24609071--24609353
40
7.1
40
88
5
414
26
27
21
24
1.99
24612697--24612749
21
2.5
20
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6
61
35
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5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
24619829--24619859
9
3.3
9
91
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19
0
0
80
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19
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42
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22
14
31
1.94
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22
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14
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15
16
41
1.89
24671778--24671872
46
2.1
45
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129
26
15
16
41
1.89
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4.2
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111
27
0
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1.57
24672871--24672961
45
2.0
45
85
2
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27
6
28
37
1.82
24673106--24673147
15
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47
2
0
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1.14
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17
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52
54
0
0
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4.2
120
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5
2
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144
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4
2
46
1.34
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43
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17
106
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2
46
1.28
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16
2.1
16
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52
50
5
0
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1.26
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91
2.0
91
90
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1
45
1.32
24674068--24674198
66
2.0
66
93
0
226
35
20
10
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
5.4
26
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2
3
34
1.30
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12
3.5
12
80
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50
67
0
0
32
0.91
24681171--24681229
27
2.1
28
84
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66
1
1
30
1.12
24681296--24681477
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3.7
47
75
11
136
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4
7
31
1.46
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28
3.2
28
65
25
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23
16
29
29
1.96
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99
2.8
98
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352
25
19
26
27
1.99
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1
332
25
18
27
28
1.98
24683002--24683290
49
5.8
49
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1
326
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19
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1.78
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27
29
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21
1.99
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22
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29
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1.30
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22
2.1
19
86
13
57
52
0
2
45
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24746240--24746314
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35
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16
5
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24
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24
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24
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2.00
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2.0
38
97
0
143
32
22
13
31
1.92
24774379--24774451
36
2.0
36
84
12
96
42
9
19
28
1.82
24781382--24781408
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
24781765--24781908
48
3.0
48
85
1
209
27
20
22
28
1.99
24787015--24787170
40
3.9
40
85
6
217
24
28
22
25
2.00
24795451--24795497
24
2.0
24
84
16
62
34
0
14
51
1.43
24803345--24803516
40
4.3
40
84
5
206
27
26
20
24
1.99
24819715--24819747
11
3.1
11
95
4
59
15
9
9
66
1.43
24824642--24824745
25
4.2
25
71
10
79
30
21
25
23
1.99
24824612--24824745
50
2.7
48
81
6
135
31
18
26
23
1.98
24824714--24824822
24
4.5
24
77
18
84
39
20
22
17
1.92
24839092--24839151
30
2.0
30
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3
26
28
1.71
24843503--24843610
43
2.5
43
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11
121
31
25
15
27
1.96
24848617--24849002
203
1.9
203
98
0
754
30
21
13
34
1.92
24850795--24850961
43
3.9
43
72
6
124
31
23
15
29
1.95
24854177--24854269
25
3.8
25
77
16
104
23
22
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24859276--24859359
42
2.0
42
95
0
150
48
14
9
27
1.74
24859278--24859372
42
2.3
42
88
1
138
50
14
6
28
1.67
24859396--24859442
19
2.5
19
93
3
78
42
12
6
38
1.69
24863055--24863094
21
1.9
21
85
10
55
22
2
25
50
1.62
24874605--24874680
38
2.0
38
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0
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17
17
28
1.92
24885151--24885210
29
2.1
29
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0
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13
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2.0
41
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0
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27
2.0
27
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12
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35
0
0
64
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11
3.6
11
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0
53
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10
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29
3.8
29
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38
8
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46
1.60
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19
2.8
18
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10
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55
1
1
40
1.21
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2.2
36
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1.20
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8
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0
0
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0
0
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2.2
120
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309
26
21
27
25
1.99
24906924--24907186
40
6.6
39
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6
278
26
21
27
25
1.99
24906925--24907221
80
3.7
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262
26
21
27
24
1.99
24911481--24911704
40
5.6
40
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10
237
24
26
22
25
2.00
24911481--24911705
79
2.8
78
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7
265
24
26
22
25
2.00
24926173--24926218
20
2.3
22
75
21
55
47
2
0
50
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24926180--24926217
10
3.9
10
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3
51
55
2
0
42
1.14
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7.0
46
88
2
400
39
14
24
21
1.91
24933701--24934042
137
2.5
138
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2
431
39
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23
21
1.91
24938303--24938426
25
4.9
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14
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37
21
24
16
1.93
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20
3.4
19
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12
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19
20
19
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1.92
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2.0
93
98
0
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2
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32
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16
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1.96
24958637--24958768
51
2.6
51
80
0
129
29
17
23
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343