Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  305  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99337299--99337388
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2.7
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86
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173
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4
1
64
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
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2.0
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6
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1.08
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.5
20
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9
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56
6
6
32
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99476506--99476679
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1.94
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18
37
1.82
99500404--99500481
38
2.1
38
95
0
138
39
12
23
24
1.89
99500532--99500745
96
2.2
96
83
1
259
28
21
28
21
1.98
99500479--99500753
48
5.8
48
75
5
218
28
20
29
22
1.98
99505643--99505672
15
2.0
15
93
0
51
23
6
46
23
1.75
99509008--99509038
15
2.1
15
93
0
53
35
6
32
25
1.82
99509195--99509233
18
2.3
17
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8
53
38
5
12
43
1.65
99511456--99511514
28
2.1
28
96
0
109
27
8
13
50
1.70
99516802--99516869
16
4.2
16
94
0
118
25
0
36
38
1.56
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2.0
44
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2
110
29
5
28
36
1.80
99517105--99517139
18
2.0
17
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54
0
0
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0.99
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3.0
157
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44
3
4
47
1.39
99517242--99517283
15
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16
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14
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52
2
0
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1.13
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15
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15
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10
52
52
0
0
47
1.00
99517399--99517440
15
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16
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14
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52
2
0
45
1.13
99517408--99517449
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99517695--99517995
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2.5
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0
559
51
3
0
43
1.27
99517778--99517930
18
8.9
18
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20
76
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1
0
42
1.16
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18
2.4
20
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14
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13
2
4
80
0.97
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14
2.9
14
88
0
53
27
5
0
67
1.11
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20
2.4
19
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13
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2
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37
1.30
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17
2.1
16
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0
17
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1.50
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1.23
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26
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1
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1.19
99534026--99534089
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2.4
27
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19
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5
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1.50
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25
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0
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2.0
22
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33
0
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22
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49
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19
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2.1
18
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25
0
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11
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0
0
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14
100
0
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7
28
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1.84
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94
0
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18
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99572357--99572400
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3.7
12
90
0
70
18
27
15
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99585776--99585822
25
1.9
25
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19
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4
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22
1.89
99593843--99593923
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2.5
33
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0
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0
0
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0
0
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118
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0
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0
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2.3
21
83
9
59
84
0
13
1
0.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343