Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  110302803

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   

This is table  208  of  343  ( 41150 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68643914--68643944
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2.6
12
100
0
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25
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1.79
68652289--68652463
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2.5
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3
226
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1.93
68652435--68653115
279
2.4
279
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1
1159
25
17
19
37
1.93
68652435--68653115
140
4.9
140
94
1
1163
25
17
19
37
1.93
68652953--68652982
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2.3
13
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0
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10
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66
1.41
68653193--68653616
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17
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1.9
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2.4
26
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20
90
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20
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2.0
16
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0
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0
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28
1.97
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22
20
25
1.98
68675846--68676110
92
2.9
90
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293
31
20
21
26
1.98
68676075--68676508
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4.8
88
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6
291
29
18
22
29
1.98
68675893--68676331
226
2.0
224
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1
646
30
19
21
28
1.98
68675916--68676466
226
2.4
225
80
3
574
31
19
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68676389--68676558
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1.9
89
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0
205
31
18
21
28
1.97
68676430--68676698
140
1.9
140
79
4
301
33
16
20
29
1.94
68677425--68677474
21
2.4
21
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93
70
8
8
14
1.34
68686186--68686251
29
2.3
29
94
0
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6
18
18
1.60
68686196--68686259
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2.2
29
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21
1.56
68691126--68691184
27
2.2
27
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100
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6
1.16
68691126--68691198
27
2.5
28
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10
94
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19
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6
1.27
68691126--68691209
27
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40
2.3
40
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112
27
16
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35
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1.9
13
100
0
50
16
32
32
20
1.94
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11
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2
2
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1.01
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3
69
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1.44
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3.2
21
79
12
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57
6
4
31
1.43
68701227--68701287
19
3.1
19
81
9
77
59
6
3
31
1.39
68701228--68701287
21
3.0
20
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4
77
60
6
3
30
1.39
68701221--68701294
21
3.6
21
81
5
71
58
5
4
32
1.40
68704345--68704484
60
2.3
60
81
6
158
27
21
19
31
1.97
68709295--68709422
13
10.2
13
64
21
58
22
3
3
70
1.18
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8
4.1
8
88
11
50
24
0
0
75
0.80
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1.9
22
85
4
59
25
9
4
60
1.47
68709630--68709665
16
2.3
15
90
4
54
13
11
0
75
1.06
68711115--68711170
20
2.8
20
84
10
71
12
1
8
76
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68711118--68711170
19
2.7
19
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13
1
7
77
1.06
68711117--68711170
6
8.5
6
80
11
63
12
1
7
77
1.05
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10
2.5
10
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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28
2.9
28
71
12
74
18
32
21
26
1.97
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36
2.1
36
90
4
118
34
19
15
30
1.93
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7
18.1
7
71
21
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29
1
2
66
1.15
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3
19.0
3
75
18
52
32
1
1
63
1.13
68722229--68722316
17
5.2
17
72
19
62
31
1
1
65
1.07
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27
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14
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29
8
0
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19
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1.94
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15
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1
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2
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14
16
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1.79
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2.1
27
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36
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21
19
1.94
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18
18
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1.94
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2.0
54
80
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119
26
20
20
32
1.97
68740328--68740494
54
3.1
54
81
1
201
25
19
17
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68740504--68740879
27
13.9
27
83
3
452
40
9
22
28
1.84
68742596--68742626
15
2.1
15
100
0
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19
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12
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0
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0
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0
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0
0
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1.00
68747081--68747112
16
2.1
16
88
11
50
59
18
0
21
1.38
68753225--68753541
146
2.1
148
83
7
401
32
19
15
32
1.93
68753225--68753541
74
4.2
74
85
5
390
32
19
15
32
1.93
68753547--68753768
72
3.0
72
83
10
277
33
19
16
30
1.94
68753732--68753837
54
1.9
55
83
5
135
38
20
14
26
1.91
68753817--68753850
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
68753688--68754312
140
4.5
140
95
1
1105
37
20
16
25
1.93
68753872--68753977
54
1.9
54
81
9
126
38
18
14
28
1.90
68754012--68754117
54
1.9
54
83
9
135
37
20
14
27
1.91
68754258--68754410
72
2.1
72
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3
220
39
22
15
23
1.91
68754285--68754527
119
2.0
123
86
6
345
38
22
13
25
1.91
68754410--68754579
69
2.5
66
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8
200
34
22
14
28
1.94
68762764--68762799
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
68770112--68770227
37
3.1
37
94
0
196
25
32
18
22
1.97
68770345--68770649
47
6.4
47
92
3
493
29
29
8
32
1.87
68770345--68770649
96
3.2
96
94
0
515
29
29
8
32
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68772414--68772532
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2.1
55
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1
220
22
23
8
45
1.79
68773711--68773985
40
6.9
40
85
1
268
25
28
21
24
1.99
68773724--68774061
80
4.2
79
77
6
269
25
27
21
25
1.99
68773888--68774061
79
2.2
80
81
10
205
24
27
21
25
1.99
68773728--68774061
40
8.4
40
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5
238
26
27
21
24
1.99
68776197--68776316
56
2.1
56
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0
231
22
23
9
45
1.81
68782364--68782417
17
3.6
17
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20
0
22
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2.0
27
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0
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0
20
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2.4
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0
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0
0
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16
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15
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1
4
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1.10
68788728--68788770
3
14.3
3
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52
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2
27
1.25
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19
2.2
19
95
0
73
78
0
17
4
0.93
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2.0
43
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27
28
19
24
1.98
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3.2
26
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0
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3.2
26
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0
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1.79
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5.0
11
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18
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18
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0
79
33
11
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1.90
68826320--68826390
36
2.0
36
82
0
88
33
12
22
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1.91
68826939--68826980
11
3.8
11
93
0
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30
4
47
16
1.67
68828023--68828109
43
2.0
43
100
0
174
47
6
29
16
1.72
68828237--68828283
23
2.0
23
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29
2
10
57
1.44
68828249--68828330
32
2.6
32
80
3
94
30
2
13
53
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68832844--68832891
19
2.6
18
83
9
53
22
4
8
64
1.38
68837070--68837119
11
4.5
11
76
0
55
80
4
12
4
1.00
68837645--68837675
10
3.2
10
95
4
55
83
0
6
9
0.79
68837648--68837703
9
6.2
9
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6
60
82
1
3
12
0.88
68838745--68838775
15
2.0
15
93
6
53
64
6
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19
1.45
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177
4.3
177
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2
979
29
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24
28
1.97
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85
1.9
85
88
2
251
26
21
21
30
1.98
68839645--68840160
262
2.0
260
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730
28
18
24
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1.98
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177
2.1
176
89
2
558
28
17
26
27
1.97
68840148--68840231
44
1.9
44
80
9
100
28
16
27
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343